Микробиологическая контаминация источников нецентрализованного водоснабжения может обуславливать высокие риски распространения отдельных инфекционных заболеваний. Источники нецентрализованного водоснабжения, как правило, характеризуются отсутствием зон санитарной охраны водоисточников, отсутствием предварительной подготовки воды, способствующими контаминации воды микроорганизмами и заражению вирусами человека. Цель — изучение спектра вирусов, содержащихся в воде нецентрализованного водоснабжения, методами лабораторной диагностики, регламентированными для определения нормируемых показателей. В течение 2014–2023 гг. ежегодно были отобраны пробы воды системы нецентрализованного водоснабжения (n = 8279). С использованием молекулярно-генетического метода описана динамика и структура контаминации воды системы нецентрализованного водоснабжения вирусами гепатита А (HAV), ротавируса группы А (Rotavirus А), энтеровируса (Enterovirus), норовируса 2 геногруппы (Norovirus GII), астровируса (Astrovirus) и аденовируса группы F (Adenovirus F). По данным проведенных исследований установлено, что за период 2014–2023 гг. средний удельный вес проб воды нецентрализованного водоснабжения, не соответствующих санитарно-гигиеническим нормативам в РФ за период с 2014 по 2023 гг. по наличию вирусов составил — 1,3 % (95 % ДИ 1,03–1,52). Доля проб воды нецентрализованного водоснабжения по содержанию Rotavirus A составила 1,78 проб (95 % ДИ 1,36–2,29), Enterovirus — 0,70 % проб (95 % ДИ 0,47–0,99), Adenovirus F — 0,30 % проб (95 % ДИ 0,01–1,67), HAV — по 0,30 % проб (95 % ДИ 0,10–0,69), Norovirus GII — 0,29 % проб (95 % ДИ 0,09–0,67), Astrovirus — 0,13 % проб (95 % ДИ 0,02–0,47)). Структура контаминации вирусами воды системы централизованного водоснабжения за 2018-2023 гг. была представлена Rotavirus A (52,6±1,1 %), Adenovirus F (30,2±2,5 %), Norovirus GII (28,6±1,1 %), HAV (26,0±1,3 %), Astrovirus (12,9±0,9 %), Enterovirus (12,0±0,5 %). Проведенными исследованиями установлено, что на сегодняшний день сохраняется необходимость мониторинга контаминации вирусами и применения методов дезинфекции при водоподготовке воды нецентрализованного водоснабжения.