Проведен анализ генов биосинтеза сидерофоров, которые содержатся в ysu и ynp локусах только Y. pestis и Y. pseudotuberculosis, различаются по структуре у разных штаммов этих иерсиний и содержат ранее неизвестные вариабельные тандемные повторы (VNTR). Целью исследования была оценка возможности использования этих VNTR в качестве генетических маркеров для внутрии межвидовой дифференциации иерсиний. На основе VNTR-маркеров созданы три пары праймеров (ysu-interF/R, ilp1F/R и ilp2F/R) и использованы для ПЦР-анализа in silico и in vitro различных штаммов иерсиний. Штаммы Y. pestis основного подвида (ssp pestis), в отличие от штаммов неосновных подвидов и Y. pseudotuberculosis, не давали ампликона с праймерами ilp1F/R, поскольку заключенная между ними область содержит IS100. Для выявления штаммов основного подвида использовали четвертую пару праймеров ilp1F-is100R, которые позволяли дифференцировать наиболее опасные штаммы Y. pestis основного подвида от неопасных штаммов неосновных подвидов. Штаммы Y. pseudotuberculosis характеризовались значительным разнообразием по размеру ампликонов с тремя парами праймеров, что позволило провести их внутривидовое генотипирование. При этом выявлена корреляция между серогруппой и геногруппой штаммов. Анализ штаммов 1 серотипа, представляющих большинство секвенированных штаммов Y. pseudotuberculosis, позволил выделить из них две геногруппы, отличные от остальных групп 1 серотипа. В первую группу входили выделенные от людей в Европе штаммы серотипа 1а, которые, как известно, имеют наибольший патогенетический потенциал. Другую геногруппу формировали выделенные от людей в Сибири и Приморье штаммы 1b серотипа, которые характеризуются наибольшей эпидемической опасностью. Таким образом, полученные четыре пары праймеров могут быть использованы для разработки дополнительных тестов для идентификации и дифференциальной диагностики наиболее опасных штаммов Y. pestis ssp pestis и Y. pseudotuberculosis 1а и 1b серотипа.