По всем вопросам звоните:

+7 495 274-22-22

УДК: 613: 576.895.122+577.213.3 DOI:10.33920/med-08-2108-09

Использование молекулярных маркеров для изучения эпидемиологически важных представителей трематод Clonorchis sinensis и Metagonimus suifunensis на Дальнем Востоке России

Шуменко Полина Геннадьевна ведущий инженер, ФГБУН «Федеральный научный центр биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии» Дальневосточного отделения Российской академии наук (ФНЦ биоразнообразия ДВО РАН), 690912, г. Владивосток, ул. Чичерина, д. 13, e-mail: polina1978_78@mail.ru, http://orcid.org/0000-0002-5924-3002
Татонова Юлия Викторовна канд. биол. наук, старший научный сотрудник, ФГБУН «Федеральный научный центр биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии» Дальневосточного отделения Российской академии наук (ФНЦ биоразнообразия ДВО РАН), 690022, г. Владивосток, пр-т 100-летия Владивостока, д. 159, e-mail: ytatonova@gmail.com, http://orcid.org/0000-0003-0114-9088

Несмотря на эпидемиологическую значимость трематод Clonorchis sinensis и Metagonimus suifunensis, эти виды являются недостаточно изученными на территории Дальнего Востока России. В данной работе мы проводим сравнение различных ядерных и митохондриальных маркеров, применяемых для популяционно-генетических исследований, на основе ранее опубликованных статей, а также новых данных по гену nad1 мтДНК, полученных для M. suifunensis. Для анализа генетической изменчивости в популяции C. sinensis подходят даже такие консервативные маркеры, как участок ITS1–5.8S-ITS2 рДНК и ген сох1 мтДНК, тогда как для оценки популяционной структуры M. suifunensis необходимо применять более вариабельные гены мтДНК. Тем не менее уровень изменчивости не является единственным определяющим фактором при выборе маркера. Ген nad1 мтДНК не выявил паттернов внутри популяции M. suifunensis, как и ген сох1, тогда как ген cytb мтДНК при меньших показателях изменчивости показал географическое подразделение и направление миграции для особей вида.

Литература:

1. Сhelomina G. N., Tatonova Y. V., Hung N. M., Ngo H. D. Genetic diversity of the Chinese liver fluke Clonorchis sinensis from Russia and Vietnam. International Journal for Parasitology. 2015; 44: 795–810.

2. Shumenko P. G., Tatonova Y. V., Besprozvannykh V. V. Metagonimus suifunensis sp. n. (Trematoda: Heterophyidae) from the Russian Southern Far East: Morphology, life cycle, and molecular data. Parasitology International. 2017; 66 (1): 982–991.

3. Tatonova Y. V., Besprozvannykh V. V., Shumenko P. G., Hung N. M., Solodovnik D. A. First description of genetic diversity for the genus Metagonimus using the complete cox1 gene sequence. International Journal for Parasitology. 2019; 49: 985–992.

4. Tatonova Y. V., Shumenko P. G. Cytochrome b as a more promising marker for analysing the distribution vector for Metagonimus suifunensis (Trematoda: Heterophyidae). Parasitology. 2021; 148: 760–766.

5. Tatonova Y. V., Сhelomina G. N., Besprozvannykh V. V. Genetic diversity of nuclear ITS1–5.8S — ITS2 rDNA sequence in Clonorchis sinensis Cobbold, 1875 (Trematoda: Opisthorchidae) from the Russian Far East. Parasitology International. 2012; 61: 664–674.

1. Сhelomina G. N., Tatonova Y. V., Hung N. M., Ngo H. D. Genetic diversity of the Chinese liver fluke Clonorchis sinensis from Russia and Vietnam. International Journal for Parasitology. 2015; 44: 795–810.

2. Shumenko P. G., Tatonova Y. V., Besprozvannykh V. V. Metagonimus suifunensis sp. n. (Trematoda: Heterophyidae) from the Russian Southern Far East: Morphology, life cycle, and molecular data. Parasitology International. 2017; 66 (1): 982–991.

3. Tatonova Y. V., Besprozvannykh V. V., Shumenko P. G., Hung N. M., Solodovnik D. A. First description of genetic diversity for the genus Metagonimus using the complete cox1 gene sequence. International Journal for Parasitology. 2019; 49: 985–992.

4. Tatonova Y. V., Shumenko P. G. Cytochrome b as a more promising marker for analysing the distribution vector for Metagonimus suifunensis (Trematoda: Heterophyidae). Parasitology. 2021; 148: 760–766.

5. Tatonova Y. V., Сhelomina G. N., Besprozvannykh V. V. Genetic diversity of nuclear ITS1–5.8S — ITS2 rDNA sequence in Clonorchis sinensis Cobbold, 1875 (Trematoda: Opisthorchidae) from the Russian Far East. Parasitology International. 2012; 61: 664–674.

Заражение различными заболеваниями через продукты питания — проблема здравоохранения во всём мире. Огромный вклад в пищевые инфекционные заболевания вносят трематоды. Среди видов, передающихся через продукты питания, наибольшее эпидемиологическое значение на Дальнем Востоке России имеют Clonorchis sinensis и Metagonimus spp., принадлежащие к надсемейству Opisthorchioidea. C. sinensis официально внесен в список биологических канцерогенов и является фактором, провоцирующим развитие холангиокарциномы [1]. M. suifunensis, ранее относящийся к виду M. yokogawai и описанный в 2017 г. по молекулярным данным как новый вид на Дальнем Востоке России [2], вызывает серьезные желудочно-кишечные расстройства. Ареалы указанных паразитов перекрываются, а также они циркулируют с использованием одних и тех же вторых промежуточных и окончательных хозяев.

В связи с эпидемиологическим значением данных паразитов необходимо их изучение и постоянный мониторинг паразитарных инфекций. Помимо проблемы диагностики видов при невысокой степени инвазии или неправильном сборе паразитологического материала, важно проводить оценку генетического разнообразия в популяциях трематод, поскольку эти данные важны для выявления исторических аспектов распространения инвазионных болезней и прогнозирования дальнейшего расширения популяций паразитов. При этом важно помнить, что для получения наиболее объективных результатов желательно использовать разные молекулярные маркеры. Целью настоящего исследования является сравнение параметров генетической изменчивости для трематод C. sinensis и M. suifunensis на территории Дальнего Востока России с использованием ядерных и митохондриальных маркеров.

На основе опубликованных статей по ядерным и митохондриальным маркерам был проведен сравнительный анализ параметров генетической изменчивости M. suifunensis [2–4], а также были использованы новые данные по полноразмерным последовательностям nad1 мтДНК, полученным из взрослых особей паразита из 8 локалитетов Приморского и Хабаровского краев, а также Еврейской автономной области, и проведено сравнение с данными для C. sinensis [1, 5].

Для Цитирования:
Шуменко Полина Геннадьевна, Татонова Юлия Викторовна, Использование молекулярных маркеров для изучения эпидемиологически важных представителей трематод Clonorchis sinensis и Metagonimus suifunensis на Дальнем Востоке России. Санитарный врач. 2021;8.
Полная версия статьи доступна подписчикам журнала
Язык статьи:
Действия с выбранными: