Высокие уровни профессиональной заболеваемости работников горнодобывающих и металлургических предприятий России требуют новых знаний и практических подходов к решению данной проблемы. Цель исследования: провести сравнительный анализ профессиональной патологии при добыче и металлургической переработке медно-никелевой руды в Кольском Заполярье. Использованы данные реестра выписок из карт учета заболеваний (Приказ Минздрава России от 28.05.2001 № 176) и Мурманского областного реестра профзаболеваний в 2009–2023 гг. Установлено, что у горняков наиболее распространенными являются болезни костно-мышечной системы (42,8 %), нейросенсорная тугоухость (20,6 %) и вибрационная болезнь (18,9 %), развитие которых обусловлено, прежде всего, несовершенством технологических процессов (66,2 %). У металлургов преобладают болезни органов дыхания (50,9 %) и хроническая интоксикация соединениями никеля (13,1 %), вызванные несовершенством санитарно-технических установок (42,1 %) и конструктивными недостатками оборудования (36,2 %). Среди причин развития нарушений здоровья у горняков большее значение, чем у металлургов, имеют тяжесть трудового процесса, шум, общая и локальная вибрация (p < 0,001). У металлургов, по сравнению с горняками, доминирующим этиологическим фактором являются вредные химические вещества. Также у них отмечено увеличение числа злокачественных новообразований (р < 0,001), отсутствовавшие при добыче руды. У горняков, по сравнению с металлургами, был выше уровень профессиональной заболеваемости (119,11 и 76,86 случаев на 10000 работников) и риск развития профессиональной патологии: ОР = 1,50; 95 % ДИ 1,16–1,94; p = 0,002. Из благоприятных изменений в 2009–2023 гг. следует отметить тенденцию к снижению ежегодного числа заболеваний как у горняков (R2 = 0,518), так и металлургов (R2 = 0,647). Полученные данные показывают основные точки воздействия для улучшения условий труда и основные нозологические формы профессиональных заболеваний, что требует совершенствования мероприятий по профилактике нарушений здоровья работников при добыче и переработке медно-никелевой руды в Кольском Заполярье.