Проведена оценка промысловой структуры и количества биологических ресурсов позвоночных и беспозвоночных для малых лимноэкосистем в лесостепной зоне юго-запада Западной Сибири. Отмечено преобладание рыбоводства, основанного на максимальном использовании природных абиотических и биотических (кормовых) ресурсов экосистем, преимущественно с ежегодным приростом рыб. Рассматриваются негативные абиотические, антропогенные и социоэкономические факторы, мешающие эффективному пользованию водными биологическими ресурсами. На территории Курганской области преобладают небольшие по площади и глубине бессточные озера с пологими, заросшими преимущественно тростником южным (Phragmites australis) берегами. Большинство озер являются мезотрофными со средними показателями биомассы фитопланктона, зоопланктона и зообентоса, а также с концентрацией биогенных веществ или эвтрофными. По результатам выполненной в Институте озероведения РАН дешифровки космических снимков 2010–2013 годов и новой оценки озерных ресурсов Курганской области (информационная система «Озера России») на территории области насчитывается 7102 водоема различного генезиса и размера площадью более 0,001 км² . За 2019 год в Курганской области в результате промыслового лова получено 3857,5 т водных биологических ресурсов, причем на долю озерного природопользования приходится 99,3% от общего количества продукции. По сравнению с 2018 годом промысел увеличился в 1,3 раза. В 2019 году выловлено 2087 т как аборигенных, так и интродуцированных видов рыб, что составило лишь 45% от рекомендованного объема вылова на озерах региона. Основная доля приходится на такие аборигенные виды рыб, как карась (Carassius gibelio, 895,5 т/год) и пелядь (Coregonus peled, 1999,4 т/год). Кроме рыбных ресурсов, область является поставщиком нерыбных водных биологических ресурсов — беспозвоночных лимнобионтов. Основными являются два вида — Gammarus lacustris (Amphipoda) и Artemia salina parthenogenetica (Branchiopoda).