Для генетической характеристики собак породы кавалер-кинг-чарльз-спаниель провели сравнительный анализ генотипов по STR-локусам ДНК взрослых собак. Животные были разделены на четыре группы, различимые по окрасу. Выявлено от 1 до 5 аллельных вариантов на локус со средним количеством аллелей 2,9 на локус. В локусах AHTk211 1, CXX279 1,REN169O18 1, INU005 1, AHTh171 1 обнаружено по три аллеля. По 4 аллеля выявлено в локусах AHTh260 1, REN54P11 1, AHT137 1, AHTk253 1, REN162C04 1. Максимальным числом аллелей характеризуется локус REN169D01 (5 аллелей) с числом эффективных аллелей – 3,0. Фиксационный индекс F (критерий Фишера–Райдера) в разных группах собак породы кавалер-кинг-чарльз-спаниель варьирует от –0,636 до –0,091. Отклонение индекса фиксации в отрицательную сторону свидетельствует об избытке гетерозигот, выявленных в четырех исследуемых группах собак. Анализ показателей генетической идентичности по Нею показал, что уровень генетического сходства между группами собак составляет от 0,793 до 0,902. Так, например, 2-я группа имеет идентичность с 3-й группой (0,857), а 1-я и 4-я группы имеют идентичность (0,793). Сравнительный анализ показал, что 1-я и 2-я группы собак имеют высокую степень генетической идентичности между собой (0,828), 2-я и 4-я (0,829), 3-я и 4-я (0,821), в то время как более удаленные по Нею 1-я и 3-я, 1-я и 4-я группы. Таким образом, между исследованными группами собак по окрасу имеет место разная генетическая идентичность, что необходимо учитывать в дальнейшей племенной работе с породой кавалер-кинг-чарльз-спаниель.