В условиях современного здравоохранения успешная работа бюджетных учреждений во многом определяется эффективным управлением материальными ресурсами, важнейшее место среди которых занимают лекарственные средства. Их учет и внутренний контроль являются ключевыми элементами бухгалтерской деятельности, обеспечивающими контроль за движением и сохранностью материальных запасов, рациональное расходование бюджетных средств и соблюдение установленных законодательством норм. Актуальность исследования обусловлена необходимостью обеспечения рационального использования бюджетных средств и строгого контроля за движением лекарственных средств в бюджетных учреждениях. При осуществлении исследования использовались следующие методы: анализ и синтез, сравнение, логический и системный подходы. В рамках статьи рассмотрены некоторые особенности бухгалтерского учета лекарственных средств, а также изменения в бюджетном учете, которые вступят в силу с 2026 года. Сделан вывод, что грамотно организованный бухгалтерский учет лекарственных средств в бюджетных учреждениях играет ключевую роль в обеспечении эффективной работы и рационального расходования финансовых ресурсов. Он не только позволяет обеспечить соответствие деятельности требованиям законодательства и нормативных актов, включая правила предметно-количественного учета, но и способствует рациональному использованию выделенных бюджетных средств. В отношении внутреннего контроля следует отметить, что на сегодняшний день он постепенно утрачивает разовый характер и приобретает форму непрерывного процесса, становясь неотъемлемым элементом системы управления. Результаты исследования будут интересны практикующим специалистам в области бухгалтерского учета бюджетных учреждений, а также научному сообществу, занимающемуся исследованиями в сфере здравоохранения.