В научных работах, посвященных поиску новых QTL и расшифровке их значения и вклада в реальные показатели у крупного рогатого скота, установлено, что данные локусы чаще всего являются породоспецифичными и подробное изучение молекулярно-генетических особенностей каждой породы является важным инструментом селекции и повышения эффективности работы племенных хозяйств. С точки зрения выбора объекта исследования, на наш взгляд значительный интерес представляют казахская белоголовая и аулиекольская породы, т. к., будучи родственными породами, разводимыми длительное время на одной климатической территории, каждая из них является носителем уникальных продуктивных качеств. Целью исследований явился поиск SNP-комплексов для QTL-маркирования мясной продуктивности у крупного рогатого аулиекольской и казахской белоголовой пород казахстанской селекции на основе данных полногеномного ДНК-типирования. В статье представлены результаты SNP-типирования крупного рогатого скота казахской белоголовой и аулиекольской пород с помощью биочипа GeneSeek GGP Bovine 150K со средней плотностью покрытия 150000 SNP (Illumina Inc., США). Полногеномное ассоциативное исследование (GWAS) было выполнено с использованием Plink, набора инструментов для анализа ассоциаций всего генома, предназначенного для выполнения ряда основных крупномасштабных анализов. Обнаружено 67 значимых SNP, связанных с признаками роста. Восемь из этих SNP относятся к аулиекольской породе, 59 – к казахской белоголовой породе. Для аулиекольской породы были обнаружены значимые ассоциации для показателей живой массы при рождении, при отъеме и живой массы бычков годовалого возраста (порог значимости для всех признаков – 0,00001). В свою очередь, у казахской белоголовой породы были обнаружены ассоциации с живой массой при рождении, при отъеме, а также среднесуточному приросту бычков.

Одним из наиболее перспективных современных методов, применяемых для идентификации локусов, контролирующих количественные признаки продуктивности у крупного рогатого скота, является метод полногеномного анализа ассоциаций (Genome-Wide Association, GWA), который позволяет установить связь между аллельной вариацией в некотором регионе генома и исследуемым признаком. Цель исследований – установить породоспецифичные SNP-маркеры мясной продуктивности крупного рогатого скота казахской белоголовой породы. Представлены результаты поиска породоспецифичных для казахской белоголовой породы генетических маркеров повышенной мясной продуктивности на основе данных ДНК-типирования животных с помощью чипа GeneSeek GGP Bovine 150K (Illumina Inc., США). Обработку данных генотипирования для каждого SNP и каждого образца выполняли с использованием программного пакета PLINK 1.9 (http://zzz.bwh.harvard.edu/plink/). Поиск уникальных областей генома проводился помощью рядов гомозиготности (ROH). Ряды гомозиготности (ROH) оценивали для каждого животного, с помощью PLINK Cattle QTL database. Выявлено 7 SNP-маркеров повышенной мясной продуктивности у крупного рогатого скота казахской белоголовой породы: аллель С (rs109910863) в гене гистоферина (histatherin (HSTN)), аллель С (rs110065568) в гене миостатина (myostatin (MSTN), аллель G (rs110320975) в гене гистоферина (histatherin (HSTN)), аллель С (rs135748641) в гене нуклеолярного протеина, взаимодействующего с доменом FHA фактора MKI67 (nucleolar protein interacting with the FHA domain of MKI67 (NIFK), аллель G (rs136552787) в гене инсулиноподобного фактора, связывающего протеин 6 (insulin like growth factor binding protein 6 (IGFBP6-202)), аллель А (rs137243785) в гене гистоферина (histatherin (HSTN-201)), аллель А (rs522351439) в гене миостатина (myostatin (MSTN)).