Удобрение водоёмов, являющееся одной из эффективных форм интенсификации, позволяет значительно увеличить выход рыбной продукции за счет максимального развития естественной кормовой базы, улучшения условий содержания рыбы.
В рыбоводстве повышение первичной продукции за счет применения удобрений является не конечной целью, а лишь начальным звеном для повышения продукции далекоотстоящего звена пищевой цепи — рыбы. Увеличение рыбопродуктивности достигается здесь благодаря стимуляции последовательного развития отдельных звеньев пищевой цепи: бактерий, фитопланктона и высшей водной растительности, затем зоопланктона и бентоса, которые, в свою очередь, служат пищей для рыб.
Механизм действия удобрений в прудах очень сложен. Внесение их в водоем без достаточных знаний потребностей полезных растений в питательных веществах часто бывает бесплодным, и успех основывается на случайности, так как, обогащая водоем питательными веществами, мы благоприятствуем развитию как вредной, так и желательной нам флоры.
Проведению работ по удобрению водоема должно предшествовать изучение его потребности в минеральных веществах.
Потребность в тех или иных удобрениях определяют разными способами: путем постановки опытов по изучению потребности в отдельных биогенных веществах, химическим анализом — содержанию биогенных элементов в воде, по прозрачности воды. Удобрение не рекомендуется вносить, если отсутствует биологическая потребность в соответствующем элементе или содержание его в воде больше нормы.
Бесконтрольное внесение удобрений ведет к излишне интенсивному развитию водорослей, поэтому необходимо выяснить сначала, на какие удобрения планктон отвечает усилением своего развития. Только в случае, если содержание того или иного биогенного элемента в воде ниже концентрации, оптимальной для доминирующих видов водорослей, внесение удобрений может вызвать увеличение первичной продукции планктона. Реакцию планктона на удобрение можно определить по интенсивности фотосинтеза, о чем можно судить по количеству выделяемого и поглощаемого кислорода.