Интерес к музейному делу на Кубе сформировался в начале XVII века, однако на первых этапах он выражался в бессознательном или неструктурированном накоплении предметов, представляющих религиозную и художественную ценность, произведений изобразительного искусства и других декоративно-прикладных жанров. В таком виде кубинская музеология существовала в колониальную эпоху и на протяжении республиканских десятилетий XX века (1902–1958).
Первые музеи на Кубе появились в XIX веке, в основном их деятельность была связана с развитием естественных наук. К началу XX века на Острове Свободы стали появляться музейные пространства многоцелевого характера с организованными коллекциями, прежде всего произведений искусства и истории.
Так, в XIX веке в Гаване был открыт Музей естественной истории и патологической анатомии. В 1899 году была основана муниципальная библиотека Сантьяго-де-Куба, сегодня это Музей Эмилио Бакарди. К 1900 году в провинции Матансас работали Исторический музей, Музей Природы, Краеведческий музей и публичная библиотека Карденаса, известные сегодня как Музей Оскара Марии де Рохаса. В 1913 году был учрежден Музей изящных искусств Гаваны, в 1944 году на острове Хувентуд был открыт музей Каса-де-ла-Финка-Эль-Абра, посвященный исторической личности выдающегося кубинского поэта и лидера революции Хосе Марти.
Несмотря на появление новых музеев, их общее число на Кубе к январю 1959 года не превышало пятнадцати. Активный рост числа музейных учреждений в стране пришелся на начало 1960-х годов, после Кубинской революции. В этот период начался этап переоценки и организации объектов культурного наследия, был разработан план развития сети музеев, созданы новые специальности, мастерские по реставрации музейного имущества и памятников.
Одновременно с работой по подготовке и обучению музейного персонала началась масштабная работа по спасению целого ряда культурных ценностей, которые из-за ненадлежащего обращения находились под угрозой разрушения. Были созданы такие организации, как Управление городской истории Гаваны (1938 г.), Национальный совет по культуре (1961 г.), Национальное управление музеев и памятников, позже переименованное в Управление культурного наследия во главе с Мартой Архона, Министерство культуры (1976 г.), Национальный реестр культурных ценностей (1977 г.), Национальный совет по охране памятников (1978 г.), с 1995 года в стране работает Национальный совет по культурному наследию.