В 1554–1557 гг. башкиры добровольно приняли российское подданство, обязательство верно служить царю, платить ясак и вошли в состав Российского государства.
Но при этом попросили сохранить за ними право вотчинного пользования занимаемыми землями. По свидетельству башкирских послов, «великий царь Иван Грозный, своим указом (повелел) эти земли отмерить, то есть определить их границы... Подтверждая это, великий царь вместе со знатными приближенными руки приложили» [1, с. 14, 15]. Об этом событии башкиры свидетельствуют: «...мы, башкирские народы, наши отцы, деды и прадеды великому государю в подданство пришли своими волями, оставья своих ханов, и великие государи нас содержали по нашей воле, а не под саблею, и дали нам земли, за которые положены на нас ясаки» [2, с. 146, 147].
Вотчинное право башкир на землю было сохранено, а в административно-территориальном отношении земли башкир входили в состав Казанского уезда и делились на 4 дороги (от монгольского слова «даруга» — начальник), «которые почитаются не для проезда, но вместо уездов», т. е. как административно-территориальные единицы. В свою очередь, дороги делились на волости, основу которых составляли роды и племена. Волости подразделялись на тюбы (аймаки). Официальное деление территории на дороги сохранилось до конца XVIII в. Согласно «Реестру и описанию башкирских волостей» в 1730 г. было 4 дороги и 58 волостей.
В 1774 г. башкиры с их землями общей площадью, по разным источникам, от 12 до 15 млн га были переданы в состав Оренбургской губернии, занимавшей в ту пору более 38 млн га земли. По указу Александра II от 15 мая 1865 г. из Оренбургской губернии была выделена Уфимская губерния в составе Уфимского, Белебеевского, Бирского, Мензелинского, Троицкого, Челябинского, Златоустовского уездов [8, с. 421–444].
Но при этом вотчинное право башкир на занимаемые ими земли сохранялось. Для защиты прав башкир на их вотчинные земли Соборное Уложение 1649 г. запретило массовую скупку башкирских земель. Эти права были подтверждены также царскими грамотами 1664, 1682 и 1694 гг., многочисленными указами государей и Правительствующего Сената (1724, 1739, 1754, 1776, 1790, 1793, 1824, 1863, 1906 гг.). Так, в Указе Правительствующего Сената от 15 апреля 1824 г. отмечается, что «башкирцы, перешедшие в подданство Царю Ивану Васильевичу, были пожалованы от Него землями с правом вотчинников, какое право впоследствии и преемниками Его было подтверждаемо…» [3, с. 19– 64]. В Указе императора Николая от 10 апреля 1832 г. «О правах башкирцев на принадлежащие им земли в Оренбургском крае» башкиры признавались «владельцами всех земель, кои ныне бесспорно им принадлежат, а согласно Указу от 20 мая 1755 г. проводилось размежевание и отграничение башкирских земель от земель других коренных народов и переселенцев-припущенников [4, с. 167–168].