Управление системой владения и пользования сельскохозяйственными землями является важнейшим элементом в определении того, смогут ли люди, общины и другие пользователи получить право на землю и связанные с ним обязанности по бережному, экологически безопасному их использованию, выполнять эти обязанности, не допуская деградации сельскохозяйственных земель.
Многие проблемы владения и пользования сельскохозяйственными землями возникают ввиду неэффективного управления, так же как и успех попыток разрешения этих проблем зависит от качества управления. Ответственное управление системой владения и пользования содействует устойчивому социальному и экономическому развитию, способному оказать помощь в искоренении нищеты и обеспечении продовольственной безопасности, создавая благоприятные условия для ответственных инвестиций.
Наряду с системой учета индивидуальных и коллективных прав владения и пользования (системы ведения кадастра и регистрации прав), единой и единообразной по необходимому минимуму перечню показателей полной и актуальной информации о количестве и качестве сельскохозяйственных угодий и земельных угодий сельскохозяйственного назначения, их оценки, важнейшим инструментом цивилизованного управления использованием продуктивных земельных ресурсов сельскохозяйственного назначения и их сохранением является регулируемое землеустроительное планирование, которое начиная с 2000 г. исчезло как институт из практики государственного регулирования.
Разработка проектов землеустроительных планов при проведении земельной реформы с перераспределением земель для обеспечения широкого и справедливого доступа к земле и всестороннего развития сельских районов с включением расходов на их реализацию в бюджеты была прекращена. Федеральная целевая программа «Развитие земельной реформы в Российской Федерации на 1999–2002 годы», утвержденная постановлением правительства Российской Федерации 26.07.1999 № 694, не была реализована. Рекомендации Федеральной службы земельного кадастра России от 25.01.2004 по составлению проектов территориального землеустройства в случае перераспределения сельскохозяйственных угодий, используемых сельскохозяйственными организациями и (или) находящихся в общей долевой собственности, разработанные в развитие действующих документов по землеустройству и положений Федерального закона от 24.07.2002 № 101‑ФЗ «Об обороте земель сельскохозяйственного назначения», также не были реализованы в связи с отсутствием бюджетного финансирования и ликвидации в 2004 г. системы государственных институтов по землеустройству (Гипроземов), переданных из ведения упраздненного в 2000 г. Государственного комитета Российской Федерации по земельной политике в ведение Министерства имущественных отношений с передачей ему функций по проведению единой государственной политики в области имущественных и земельных отношений, координации деятельности в области земельных отношений иных федеральных органов исполнительной власти и органов исполнительной власти субъектов Российской Федерации (постановление Правительства РФ от 18.07.2000 № 536), в том числе и разработке проектов федеральных законов и иных нормативных правовых актов по вопросам проведения земельной реформы (положение о Министерстве имущественных отношений РФ, утвержденное постановлением Правительства РФ от 03.06.2002 № 377).