История старейшего профильного университета берет свое начало в 1930 г., когда в соответствии с приказом по Наркомату земледелия СССР № 232 на базе факультета овцеводства Московского зоотехнического института был открыт Московский институт овцеводства, в самом центре исторического Ставрополя, на улице Невинномысской (сейчас улица Мира).
Первый выпуск зоотехников состоялся в 1933 г. и насчитал почти 90 человек. Высшее учебное заведение к тому времени называлось Северо-Кавказский зоотехнический институт.
На протяжении девяти десятилетий вуз преображался, рос и развивался. Сельскохозяйственный институт (1930– 1994 гг.), затем Академия (1994– 2001 гг.), и вот сегодня Ставропольский государственный аграрный университет (2001 г. — н. в.) — лучший профильный вуз страны (по рейтингу Минсельхоза России на 2017–2019 гг.).
Ставропольский ГАУ сегодня — это 10 факультетов (в том числе факультет среднего профессионального образования), 126 образовательных направлений (бакалавриат, специалитет, магистратура, аспирантура), 39 кафедр, 18,5 тыс. студентов и слушателей, 1500 человек профессорско-преподавательского состава, тысячи квадратных метров учебных площадей, 9422 гектара полей и теплиц на учебноопытном хозяйстве, 56 инновационных подразделений, конноспортивная школа, виварий, спортивно-оздоровительный комплекс, уникальная научная библиотека, 5 общежитий.
Ставропольский ГАУ — единственный в стране трехкратный обладатель Премии Правительства в области качества. Дважды аграрный университет признан победителем всероссийского конкурса «Российская организация высокой социальной эффективности» с присуждением ему высшей награды — Гран-при. Ставропольский государственный аграрный университет в течение 20 лет стабильно входит в число лидеров рейтинга аграрных вузов России, последние несколько лет — занимает первую строчку. Заслужил университет признание и на международном уровне, он является трижды обладателем приза престижного европейского конкурса EFQM — награда в области «Совершенство». Университет — единственное образовательное учреждение, достигнувшее такого признания.