Юг Западной Сибири располагает всеми условиями, необходимыми для эффективного ведения аквакультуры. При этом разнообразие климатических, гидрологических и экономических особенностей региона обуславливает выбор наиболее перспективных направлений в каждой области (рис.1).
Рыбохозяйственный водный фонд Новосибирской области составляет более 500 тыс. га. Одним из наиболее перспективных вариантов развития аквакультуры в области является пастбищный нагул товарной рыбы.
В 90-е гг. прошлого столетия произошло резкое сокращение объемов пастбищного выращивания товарной рыбы в связи с высокой стоимостью посадочного материала, снижены показатели работы рыбопитомников, прекращена селекционно-племенная работа во всех специализированных хозяйствах. Снижение объемов заготовки рыбоводной икры пеляди в традиционных местах сбора (Средняя Обь), высокая себестоимость транспортировки и инкубации привели к сокращению производства жизнестойкой личинки до 10–20 млн экз. (причем не ежегодно), что явно недостаточно для региона. Все это привело не только к сокращению объемов вылова рыбы, но и к ухудшению качественного состава уловов (замена ценных рыбоводных объектов на мелкого частика). Негативно сказалось на состоянии рыбных запасов и полное прекращение рыбохозяйственной мелиорации на водоемах. Практически не используются построенные в прошлом столетии прудовые товарные хозяйства (общей площадью 3,5 тыс. га).
Индустриальное рыбоводство в области в настоящее время полностью отсутствует, хотя для его развития есть достаточные возможности. Это, в частности, подтверждается работой бассейнового хозяйства на Новосибирской ТЭЦ-2 (90-е гг. прошлого столетия). Кроме того, в области имеются значительные запасы геотермальных вод, пригодных для целей аквакультуры.
Положительные тенденции в аквакультуре Новосибирской области наметились лишь в конце первого десятилетия XXI в. В последние годы в области активно развивается работа по производству рыбоводной молоди сиговых рыб для выпуска в р. Обь с целью сохранения и увеличения численности популяций этих видов. К сожалению, основной объем зарыбления производится личинками, что снижает эффективность этих работ. Причина — отсутствие необходимого количества питомных площадей и бассейновых хозяйств для подращивания молоди. В настоящее время действуют всего 2 хозяйства, располагающие питомными площадями: рыбоводное хозяйство ООО «Рыбхоз» (ранее — рыбопитомник ФГБУ «Верхнеобьрыбвод») и рыбоводное хозяйство Алтайского филиала ООО «Новосибирский рыбзавод».