Аэробы — эшерихии (до 80 % случаев) и коагулазоотрицательные стафилококки (КОС), облигатные анаэробы — эубактерии и пептострептококки. Реже пептококки, бактероиды, а также протей, грибы рода Candida, микоплазмы, уреаплазмы и др. У больных с мочевым катетером, а также у беременных женщин, доминирует микст-инфекция двух, трех и даже четырех патогенов. Чаще всего (в 51,1 % случаев) это аэробно-анаэробные ассоциации, гораздо реже (в 10,6 % случаев) — аэробно-аэробная смешанная инфекция, причем в случае двухкомпонентной инфекции преобладает ассоциация эшерихии плюс КОС, а в случае выделения трех патогенов доминируют облигатно-анаэробные микроорганизмы (пептострептококки, эубактерии в сочетании с E. coli и КОС). В данной группе пациентов частота обнаружения трехкомпонентной микст-инфекции более чем в два раза превышает частоту выделения двух патогенов [1, 3, 4].
Важную роль в реализации инфекции и в хронизации заболевания играет нарушение уродинамики при мочекаменной болезни, сдавлении мочевыводящих путей извне, инструментальных манипуляциях, неврологических заболеваниях, сахарном диабете. При этих состояниях в почечную паренхиму проникают бактерии, лишенные специфических инвазивных факторов. Данные нарушения мочевыводящих путей врожденного и приобретенного характера приводят к повышению давления в чашечно-лоханочной системе, сдавлению тонкостенных почечных вен и застою венозной крови, нарушению лимфообращения в почке, что нарушает проницаемость сосудистой стенки и создает условия для внедрения микробов в интерстициальную ткань [7].
Возбудители попадают в почечную ткань чаще восходящим, реже гематогенным и лимфогенным путем. Присутствие бактерий, их рост и выделение эндо- и экзотоксинов вызывают местный и гуморальный ответ организма. Под воздействием хемотаксического фактора в интерстиций мигрируют полиморфноядерные клетки, макрофаги, лимфоциты, эндотелиальные клетки, где они активируются и выделяют цитокины (фактор некроза опухолей, интерлейкины-1, 2, 6, 8, 10, интерфероны), свободные радикалы кислорода, лизосомальные ферменты, медиаторы воспаления, а также вызывают образование оксида азота.