Водоемы Московской области подвергаются систематическому антропогенному воздействию различной природы, такому как стоки сельскохозяйственных предприятий, выбросы промышленных предприятий, загрязнение от транспорта. В конце ХХ века систематические исследования и контроль над экологическим состоянием малых водоемов перестали осуществляться на постоянной основе [18].
Степень загрязнения водоема не является постоянной величиной и изменяется в зависимости от сезона и способности водной среды к самоочищению. Наибольший уровень загрязнения отмечается в следующие периоды: ранней весной при попадании в водоем большого количества естественных стоков и в начале осени, когда заканчивается период вегетации высшей водной растительности и начинается период деструкции органического вещества. Весной определение экологического состояния водной среды по составу альгофлоры, на наш взгляд, не является оптимальным, поскольку в связи с низкими температурами состав водорослей представлен лишь несколькими таксономическими единицами, что не позволяет достоверно оценить степень сапробности водоема. Максимального развития видовое разнообразие фитопланктона в средней полосе России достигает в третьей декаде августа [5].
Детальное изучение альгофлоры позволяет оценить эвтрофикацию водоема, наличие биогенных элементов и загрязнителей антропогенной природы [4]. Существует множество работ, которые используют данный метод оценки для определения состояния водоема, хотя разные авторы по-разному интерпретируют результаты исследований. Направление сезонных сукцессий во всех малых водоемах Московской области имеет общие черты, хотя может варьировать по времени [16].
Для определения сапробности одной из наиболее показательных групп водорослей являются диатомовые [12; 18]. Они встречаются в различных экотопах и обладают широким спектром чувствительности к антропогенному воздействию. Однако для водоемов мезотрофного типа для точного установления степени загрязнения этой группы водорослей недостаточно. В таких случаях необходимо принимать во внимание таксономическое распределение в отделах сине-зеленых и зеленых водорослей [3].