По всем вопросам звоните:

+7 495 274-22-22

УДК: 616–036.22

Опыт применения методики RAPD-PCR для идентификации штаммов E. coli у пациентов с инфекциями мочевыводящих путей

Сурсякова Ксения Ивановна преподаватель кафедры эпидемиологии, микробиологии и вирусологии, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Алтайский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБОУ ВО АГМУ Минздрава России), 656038, Алтайский край, г. Барнаул, пр-т Ленина, д. 40, Е-mail: boydika@ yandex.ru
Сафьянова Татьяна Викторовна д-р мед. наук, профессор, заведующая кафедрой эпидемиологии, микробиологии и вирусологии, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Алтайский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБОУ ВО АГМУ Минздрава России), 656038, Алтайский край, г. Барнаул, пр-т Ленина, д. 40, Е-mail: tvsafyanova@yandex.ru
Прокопьев Василий Валерьевич канд. биол. наук, доцент кафедры эпидемиологии, микробиологии и вирусологии, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Алтайский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБОУ ВО АГМУ Минздрава России), 656038, Алтайский край, г. Барнаул, пр-т Ленина, д. 40, Е-mail: vasily78@mail.ru

Инфекции мочевыводящих путей (ИМП) в Российской Федерации имеют широкое распространение и часто встречается у детей, взрослых, поражая людей в самый активный период их жизни. Течение ИМП определяется рядом предрасполагающих факторов, таких как возраст, пол, общее состояние пациента, наличием иммунокомпрометирующих заболеваний. Бесконтрольное применение антибактериальной терапии нередко является предрасполагающим фактором хронизации процесса в верхних отделах мочевыводящих путей. Для определения идентичности штаммов E. сoli. В 2019 г. был проведен отбор биологического материала у 50 пациентов КГБУЗ «Алтайский краевой госпиталь для ветеранов войн» с инфекциями мочевыводящих путей (хронический пиелонефрит и хронический цистит) на предмет оценки бактериурии. По результатам бактериологического исследования было выделено 23 штамма E. сoli, после чего был выполнен молекулярно-генетический анализ с применением метода Random Amplified Polymorphic DNA штаммов E. Coli, полученных от пациентов с инфекциями мочевыводящих путей, проведена оценка их идентичности. Результаты проведенного исследования показали, что используемый метод является надежным методом эпидемиологического картирования и определения взаимосвязей между близкородственными сортами и штаммами микроорганизмов, выделенных из различных источников. Проведения одного бактериологического исследования мочи при инфекциях мочевыводящих путей недостаточно, только высокотехнологичные методики позволяют установить точный вид возбудителя данных инфекций и позволят подбирать правильное назначение антимикробными препаратами у пациентов с данной группой инфекций.

Литература:

1. Бузолева Л. С. Характеристика штаммов бактерий, выделенных от больных с инфекциями мочевыводящих путей. Тихоокеанский медицинский журнал. 2011; 1: 51–53.

2. Каприн А. Д. Катетер-ассоциированные инфекции мочевых путей. Справочник врача общей практики. 2016; 3: 34–38.

3. Перепанова Т. С. Нозокомиальные инфекции мочевыводящих путей. Катетер-ассоциированные инфекции мочевыводящих путей. Послеоперационные инфекционные осложнения. М.: «Практическая медицина», 2013, 251–270.

4. Сергевнин В. И. Факторы риска и профилактика внутрибольничных катер-ассоциированных инфекций мочевыводящих путей. Заместитель главного врача. 2016; 4 (119): 82–85.

5. Сушинский В. Э. Инфекции мочевыводящих путей у пациентов старших возрастных групп: особенности микробного статуса. Клиническая геронтология. 2010; 9–10: 83.

6. Техова И. Г. Проблемы организации дезинфекционно-стерилизационных мероприятий в учреждениях здравоохранения. Пути решения Дезинфекционное дело. 2011; 2: 18.

7. Урология: клинические рекомендации. — 3-е изд., перераб. М.: «Практическая медицина», 2014, 320–369.

8. Ярец Ю. И. Хронические инфекции мочевыводящих путей: состояние проблемы Медико-биологические проблемы жизнедеятельности. 2015; 2 (14): 18–23.

9. Flores-Mireles A. L., Walker J. N., Caparon M., Hultgren S. J. Urinary tract infections: epidemiology, mechanisms of infection and treatment options Nature Reviews Microbiology. 2015; 13 (5): 269–284.

10. Boom R., Sol C. J., Salimans M. M. Rapid and Simple Method for Purification of Nucleic Acids. Clinical Microbiology. 2010; 28: 495–503.

1. Buzoleva, L. S. Characteristics of bacterial strains isolated from patients with urinary tract infections. Pacific medical journal. 2011; 1: 51–53. (in Russian)

2. Kaprin, A. D. Catheter-associated urinary tract infections. Handbook for the General practitioner. 2016; 3: 34–38. (in Russian)

3. Perepanova, T. S. Nosocomial urinary tract infections. Catheter-associated urinary tract infections. Postoperative infectious complications. Moscow: «Practical medicine». 2013, 251–270. (in Russian)

4. Sergevnin, V. I. risk Factors and prevention of nosocomial boat-associated urinary tract infections. Deputy chief physician. 2016; 4 (119): 82–85. (in Russian)

5. Sushinsky, V. E. urinary tract Infections in patients of younger age groups: peculiarities of microbial status. Clinical gerontology. 2010; 9–10: 83. (in Russian)

6. Tekhov, I. G. Problems of organization of disinfection-sterilization activities in healthcare facilities. Solutions Disinfection case. 2011; 2: 18. (in Russian)

7. Urology: clinical recommendations. — 3rd ed., revised. Moscow: «Practical medicine». 2014, 320–369. (in Russian)

8. Yaretz, Yu. I. Chronic urinary tract infections: state of the problem. Medical and biological problems of life. 2015; 2 (14): 18–23. (in Russian)

9. Flores-Mireles A. L., Walker J. N., Caparon M., Hultgren S. J. Urinary tract infections: epidemiology, mechanisms of infection and treatment options Nature Reviews Microbiology. 2015; 13 (5): 269–284.

10. Boom R., Sol C. J., Salimans M. M. Rapid and Simple Method for Purification of Nucleic Acids. Clinical Microbiology. 2010; 28: 495–503.

В Российской Федерации инфекции мочевыводящих путей (ИМП) имеют большое распространение и часто возникают у детей и взрослых трудоспособного возраста [1–3]. По данным литературных источников, ИМП в общей структуре инфекционной заболеваемости занимают третье место после респираторных и кишечных инфекций [4–6]. Течение ИМП определяется рядом предрасполагающих факторов, таких как возраст, пол, общее состояние пациента, наличием иммунокомпрометирующих заболеваний (сахарный диабет, нейтропения и др.). Применение антибактериальной терапии может вести к хронизации процесса в верхних отделах мочевыводящих путей [8, 9].

Цель исследования: провести молекулярно-генетический анализ с применением метода Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD-PCR) штаммов E. сoli, полученных от пациентов с ИМП, проходящих лечение в КГБУЗ «Алтайский краевой госпиталь для ветеранов войн» (КГБУЗ «АКГВВ»), и оценить их идентичность.

В 2019 г. у пациентов с ИМП, проходящих лечение в КГБУЗ «АКГВВ», был произведен отбор биологического материала и проведено его бактериологическое исследование на предмет наличия бактериурии. Все отобранные 50 образцов мочи были от пациентов, имеющих хронический пиелонефрит и хронический цистит. Всего из отобранного материала было выделено 23 штамма E. сoli. Идентификация микроорганизмов с учетом их сахаролитических свойств проводилась с помощью программы ABIS online. По результатам бактериологического исследования был проведен молекулярно-генетический анализ, используемой методикой была выбрана RAPD-PCR.

Оборудование, использованное для определения молекулярно-эпидемиологических характеристик выделенных штаммов методом RAPD-PCR, было безвозмездно предоставлено иммунологической лабораторией КГБУЗ «Краевая клиническая больница» (электрофорезная горизонтальная камера Sub cell GT cell (Bio Rad), трансиллюминатор компактный, 254 нм, фильтр 200 × 200 мм, лампы 6 × 8 Вт, ECX-F2). В процессе проведенного исследования были применены следующие расходные материалы: AppliChem Этидиум бромид, AppliChem Агароза с низким электроэндоосмосом, EEO 0.09–0.13,10*TBE буфер, стерильная упаковка.

Для Цитирования:
Сурсякова Ксения Ивановна, Сафьянова Татьяна Викторовна, Прокопьев Василий Валерьевич, Опыт применения методики RAPD-PCR для идентификации штаммов E. coli у пациентов с инфекциями мочевыводящих путей. Санитарный врач. 2020;2.
Полная версия статьи доступна подписчикам журнала
Язык статьи:
Действия с выбранными: