Ладожское озеро является одним из крупнейших водных объектов Российской Федерации, имеющих рыбохозяйственное значение. Ихтиофауна озера характеризуется богатством и многообразием и включает более 50 видов и разновидностей пресноводных рыб, отличающихся биологическими свойствами и хозяйственной ценностью.
В рыбопромысловую зону Ладоги, составляющую около 50% акватории, входят западный и южный районы в пределах Ленинградской области, а также северный и северо-восточный — в Карелии. Расположение Ладожского озера и его водосбора в экономически развитом северо-западном регионе обусловливает влияние различных антропогенных факторов на компоненты озерной биоты и водную экосистему в целом. Загрязнение вод, эвтрофирование, промысловая нагрузка определяют на современном этапе основные тенденции динамики структуры биоценозов Ладоги [15].
Негативные последствия антропогенного воздействия привели к сокращению численности ценных рыб (преимущественно с длительным жизненным циклом и специфичных для олиготрофных водоемов) — озерного лосося, озерной форели, некоторых видов озерно-речных сигов [14; 21]. Одним из основных объектов рыболовства Ладожского озера является корюшка (Osmerus eperlanus n. Ladogensis Berg), ее доля в общем годовом улове составляет около 40% [1; 17]. Состояние запаса корюшки вполне удовлетворительное, так как на жизнедеятельности этого короткоциклового вида антропогенное давление сказывается в меньшей степени. Встречаемость в общем улове прочих промысловых рыб — сигов, ряпушки, леща, плотвы, судака, окуня — составляет от 4 до 13%. В целом для показателей уловов в Ладожском озере характерна специфическая динамика, детерминирующим фактором которой является изменение общего трофического статуса водоема.
Наиболее чувствительным компонентом водного биоценоза к трансформации условий окружающей среды является микробное сообщество. Благодаря адаптационным возможностям микробные популяции реагируют на вариативность биотопа численной и структурной перестройкой в зависимости от источника воздействия, следствие которой — адекватное изменение микробиоты водных организмов, в том числе ихтиофауны. В соответствии с нормативными требованиями промысловые биоресурсы, используемые в качестве рыбного сырья, подлежат оценке по установленным микробиологическим критериям безопасности [22]. Превышение гигиенических нормативов определяемых показателей, с одной стороны, свидетельствует о бактериальной контаминации объектов рыболовства и их небезопасном микробиологическом статусе, с другой — косвенно указывает на микробное загрязнение водных масс. В условиях значительной антропогенной нагрузки на экосистему водоема необходимость детекции факторов, влияющих на состояние биоресурсов и среду их обитания, очевидна, что определяет актуальность и информативную значимость микробиологической оценки традиционно востребованного массового промыслового вида — ладожской корюшки.