14 ноября 2007 г. — в соответствии с распоряжением Правительства РФ к Московскому государственному университету путей сообщения (МГУПС — Московский институт инженеров транспорта МИИТ) был присоединён Российский открытый технический университет путей сообщения (РГОТУПС), который до 1995 г. был заочным Институтом инженеров железнодорожного транспорта. После присоединения РГОТУПС был переименован в Российскую открытую академию транспорта МГУПС.
27–29 апреля 2009 г. — приказом Федерального агентства по образованию Московский инженерно-физический институт (МИФИ) был переименован в Национальный исследовательский ядерный университет «МИФИ». Затем к нему был присоединён ряд вузов и техникумов, в том числе Обнинский государственный технический университет атомной энергетики, а также институты, подведомственные «Росатому»: Новоуральский государственный технологический институт, Саровский государственный физико-технический институт и др.
20 сентября 2010 г. — указом Президента РФ была создана Российская академия народного хозяйства и государственной службы при Президенте РФ (РАНХиГС). В неё вошли Академия народного хозяйства при Правительстве РФ и Российская академия государственной службы при Президенте РФ, а также 12 других федеральных образовательных учреждений.
28 декабря 2011 г. — приказом Министерства образования и науки РФ было осуществлено слияние Московского государственного технического университета (Московский автомеханический институт — МАМИ) и Московского государственного университета инженерной экологии. На их основе был создан Московский государственный машиностроительный университет (МАМИ). Впоследствии, 20 декабря 2012 г., дополнительным приказом к МАМИ были присоединены Московский государственный открытый университет им. В.С. Черномырдина и Московский государственный вечерний металлургический институт.
29 декабря 2011 г. — приказом Минобрнауки к Московскому государственному университету дизайна и технологии был присоединён Московский государственный текстильный университет им. А.Н. Косыгина.