Научные подразделения института, обеспечивающие методологическую и технологическую основу сохранности продовольственных товаров и хлебопродуктов являются основой образования ФГБУ НИИПХ Росрезерва. При образовании в 1939 году Центральной научно-исследовательской лаборатории (ЦНИЛ ГУГМР) одним из первых был создан хлебный отдел, где велись интенсивные научные работы, связанные с исследованием изменения качества зерна при длительном хранении, установлением сроков хранения зерна, с определением потерь зерна при дыхании и хранении, с изучением влияния температурно-влажностных условий на сохранность зерновой массы, с разработкой и оценкой эффективности методов борьбы с вредителями зерна и другие. Отделом энтомологии и микробиологии проводились научные работы по энтомологии амбарных вредителей, по изменению микробиологии зерна при хранении. В 1958 году работы по зерну и зернопродуктам были прекращены, так как эти товары были переданы в систему Минзаготовок. Большинство НИР по длительному хранению этой продукции, выполненных в те далекие годы, а их было более 80, не потеряли своей актуальности и в настоящее время.
С 1947 года в продовольственном отделе начались исследования по длительному хранению бакалейных (сахара, чая, макаронных изделий, сухарей) и других товаров (животного масла, рыбных консервов, сгущенного молока, замороженного мяса), что положило начало целому направлению в деятельности научного подразделения — технологии длительного холодильного хранения продовольственных товаров. В ходе выполнения работ в те далекие годы оценивалось не только качество пищевых продуктов, но и разрабатывались мероприятия по повышению стойкости товаров: устанавливалось влияние условий их хранения, вида консервных банок, влияние рецептур и технологии производства на стойкость товаров при хранении. Также начаты были работы по исследованию потерь мороженого мяса при хранении.
В развитие научных исследований при длительном хранении продовольственных товаров для системы госрезервов большой вклад внесли ученыетовароведы — ранее учившиеся или работавшие в Институте народного хозяйства имени Г.В. Плеханова: Ловачев Л.Н., Церевитинов О.Б., Родионова И.Ф., Голубева И.Л., Падарян Э.М., Гурьева К.Б., Панкрухина Г.Н., Райкова И.Б., Гут А.С., Иванова Е.В. и многие другие.