Активное развитие института государственной регистрации прав на недвижимое имущество и сделок с ним начинается с момента становления и развития рыночных отношений в Республике.
Так, в 1998 г. был принят Закон Кыргызской Республики «О государственной регистрации прав на недвижимое имущество и сделок с ним». Для реализации данного закона в 1999 г. было образовано Государственное агентство по регистрации прав на недвижимое имущество при Правительстве Кыргызской Республики (Госрегистр Кыргызской Республики).
Именно этими условиями было обусловлено создание регистрационной системы на базе Государственного агентства по землеустройству, геодезии и картографии при Правительстве Кыргызской Республики и Бюро технической инвентаризации (БТИ).
Госрегистр Кыргызской Республики, в состав которого входили картографическая служба, проектный институт по землеустройству и государственная земинспекция, не только создавал равные условия для всех участников рынка недвижимости независимо от форм собственности в части гарантии и защиты прав, но и позволял сократить количество инстанций, посещаемых участниками рынка недвижимости для оформления сделок и последующей регистрацией прав по принципу «единого окна», не заставляя обращаться их в различные инстанции.
Образование Госрегистра Кыргызской Республики с приданием ему функций, никогда ранее не осуществлявшихся ни одним государственным органом в Республике, было настоятельным требованием времени и новых имущественных правоотношений между частными, муниципальными и государственными собственниками недвижимости.
В настоящее время в Кыргызской Республике сформировались землепользования частных лиц и местных сообществ, регистрация прав которых невозможна без определения границ, географического местоположения земельных участков, а также строений и зданий, расположенных на них
В 2009 г. в результате реформы государственного управления в соответствии с постановлениями Правительства Кыргызской Республики от 17.11.2009 № 708 и от 05.02.2010 № 75, Госрегистр Кыргызской Республики преобразован в Департамент кадастра и регистрации прав на недвижимое имущество Государственной регистрационной службе при Правительстве Кыргызской Республики.