Владимир Леонидович Малыгин в 1979 г закончил лечебный факультет Ярославского медицинского института. Работал врачом-ординатором, зав. отделением, заместителем главного врача Тульской областной психиатрической больницы.
В 1995 году возглавил лабораторию психологической реабилитации населения, пострадавшего от аварии на ЧАЭС в НИИ новых медицинских технологий г. Тулы. С 1999 г по 2005 г заведовал курсом психиатрии и наркологии медицинского факультета Тульского госуниверситета. В 2005 г. в Московском государственном медико-стоматологическом университете им. А. И. Евдокимова (сейчас Российский университет медицины) основал кафедру психологического консультирования, психокоррекции и психотерапии, которой продолжает руководить по настоящее время.
В 1992 г В. Л. Малыгин защитил кандидатскую диссертацию на тему «Клинико-патогенетические подходы к терапии шизоаффективных приступов шизофрении». В 2000 г. Владимир Леонидович завершил большую научно-исследовательскую работу по проблемам населения, пострадавшего от катастрофы на Чернобыльской АЭС. Предложена новая клинико-патогенетическая классификация психических нарушений у пострадавших от ионизирующего излучения. На основе сформированных концепций формирования психических расстройств к пострадавших от радиационного воздействия разработана патогенетическая система терапии выявляемых психических нарушений. По результатам научных исследований им в Ученом совете Московской медицинской академии им. Сеченова была защищена докторская диссертация «Клинико-патофизиологические закономерности развития психических нарушений радиационного генеза и система их терапии».
Владимир Леонидович Малыгин является одним из основателей нового направления научных исследований в области поведенческих зависимостей: зависимости от азартных игр, интернет-зависимости. Результатом проведенных исследований явилась разработка клинико-психологических моделей формирования интернет зависимости, зависимости от азартных игр и комплексных дифференцированные подходы к их терапии.