В статье рассмотрены вопросы развития и стратегического аудита в системе государственного аудита. В исследовании определены основные сферы его применения и уточнены элементы системы стратегического аудита в госсекторе. Авторами обозначен ряд проблем дискуссионного характера (например, неопределенность взаимосвязи между стратегическим аудитом как видом последующего контроля и экспертизой документов стратегического планирования как способом проведения предварительного контроля; наличие правовой нормы об участии внешних органов контроля в формировании системы целевых показателей по составу и количественным значениям в документах стратегического планирования; отсутствие государственного стандарта и методики проведения стратегического аудита) и предложены пути их решения.