Потоки вещества, особенно биогенная миграция элементов, являются основой функционирования водных экосистем. В настоящее время не разработаны модели для оценки процессов накопления органического вещества в малых озерах, тогда как именно они являются основными накопителями органического вещества и аллохтонного, и автохтонного происхождения. В предлагаемой работе приведен расчет вклада гидробионтов в общий седиментационный поток в типичном малом озере лесостепной зоны Барабинской низменности с целью определения источников формирования органического вещества в донных отложениях. Проведена оценка современного состояния экосистемы водного объекта по характеристикам биоценоза: зообентос, фитопланктон, зоопланктон, высшая водная растительность. Определены продукционные характеристики различных звеньев гидробиоценоза. Поставлены эксперименты с седиментационными ловушками. Показано, что озеру Нижнему свойственны все признаки эвтрофного водоема: перепроизводство первичной продукции при избыточном запасе органических веществ в донных отложениях; десинхронизация в развитии продуцентов и консументов; угнетение пастбищной цепи и сдвиг потока веществ и энергии в детритную цепь. Сапропель в озере Нижнем имеет макрофитно-планктонный генезис, что характерно для активно заболачивающихся стареющих озерных экосистем лесостепной области. Доля автохтонного органического вещества составляет 34%. Более половины седиментационного потока — поступление с водосбора. Скорость накопления сапропелей может ежегодно колебаться в зависимости от погодных условий и развития продуцентов и составляет в среднем 1,25 см в год. Добыча сапропеля и очистка котловины озера от накопившихся органических отложений могут способствовать в перспективе восстановлению рыбопродуктивности водоема.

Проведено сравнение численных показателей зоопланктона и зообентоса реки Чулым в сравнении с таковыми, полученными в 1972–1973 годах, чтобы оценить трансформацию экосистемы, произошедшую за 50 лет. Показано, что зоопланктон реки Чулым претерпел кардинальные изменения как в качественном, так и в количественном плане. Численность зоопланктона возросла в 4–5 раз за счет мелких коловраток. При этом биомасса, а значит, и кормовая ценность снизилась более чем в 2 раза за счет сокращения численности крупных ракообразных. Изменился видовой состав структурообразующих видов зоопланктона. Число видов коловраток в русле реки сократилось с 55 до 34. Из состава доминантов выпали виды р. Trichocerca и Polyarthra и стали доминировать представители р. Brachionus. Наблюдается значительное изменение и структуры зообентоса: численность организмов в русле реки Чулым в 5 раз ниже, чем в 1970-х годах. Видовой состав в донных сообществах за 50 лет почти не изменился, при этом выросла доля некоторых гетеротопных насекомых (ручейники, поденки, веснянки), а доля олигохет, моллюсков и хирономид в биомассе снизилась в 4–5 раз. В придаточных водоемах Чулыма показатели численности и биомассы зоопланктона и зообентоса за последние 50 лет остались более или менее стабильны, что может свидетельствовать о наличии хронического загрязнения, влияющего на экосистему основного русла реки и не успевающего оказать негативное воздействие на придаточные водоемы во время паводка. Показатели качества воды в реке Чулым и ее придаточных водоемах, согласно биотическим индексам, низки и соответствуют невысокому или плохому классу качества вод. Такие условия неблагоприятны для дальнейшего развития зообентоса и, соответственно, ихтиофауны, для которой донные беспозвоночные являются кормовой базой.