В статье представлены результаты гидрохимических, гидробиологических, паразитологических и ихтиологических исследований, выполненных в водах озера Сенеж в весенний период 2020 г., проведено сравнение с аналогичными работами, проведенными в 2004–2006 гг. Изученность экосистемы данного водного объекта крайне мала. В размерной структуре выловленных видов рыб в 2020 г. наблюдается динамика с хорошим воспроизводительным потенциалом. Коэффициент упитанности высокий у всех видов рыб. Во всех обследованных группах наблюдается значительное преобладание самок над самцами, за исключением леща. На данном водном объекте по результатам исследований отмечено превышение ПДК для рыбохозяйственных водоемов по железу в 2,8 раза. По всем остальным показателям в пробах воды и донных отложениях содержание токсичных элементов не превышало ПДК. Бактериологический анализ воды показал незначительное превышение бактериального загрязнения только в районе станции исследования 6, что, скорее всего, носит антропогенный характер и является результатом загрязнения прибрежной зоны озера. Результаты паразитологического анализа рыб из озера Сенеж свидетельствуют о высоком уровне заражения паразитами. У 3 обследованных видов рыб было обнаружено 11 видов паразитов, которые были представлены на 73% трематодами на стадии метацеркарий и марит. Существующая проблема эргазилеза рыб в данном водоеме с 2005 г. и до настоящего времени сохраняется. У судака на жабрах были обнаружены паразитические рачки Ergasilus sieboldi. Данная работа будет интересна исследователям, которые будут изучать как озеро Сенеж, так и другие водоемы Московской области.