А. И. Ищенко одним из первых в стране начал заниматься разработкой и внедрением в клиническую практику эндоскопических методов диагностики и хирургического лечения гинекологических заболеваний. Им разработаны хирургические методы лечения распространенных форм эндометриоза, авторские методики хирургических операций для лечения массивных акушерских кровотечений, миомы матки, генитального пролапса, бесплодия.