Оздоровление среды обитания живых организмов от отходов сельского хозяйства и получение от них безопасных продуктов является наиболее актуальной и нерешенной проблемой для регионов России. Огромные территории регионов России загрязнены различными отходами, влияющими на животноводство, растениеводство АПК и снижающими качество сырьевой продукции животного и растительного происхождения, подавляющими природную, естественную резистентность сельскохозяйственных животных, птиц и растений. Вследствие чего происходит и нарушение технологии воспроизводства, обеспечения экологической безопасности среды обитания сельскохозяйственных животных и урожайности сельскохозяйственных культур, снижение экономической эффективности отраслей сельского хозяйства, при этом больше всего наносят значительный экологический ущерб, выводя плодородные земли из сельскохозяйственного оборота, тем самым подрывая сырьевую кормовую базу для животноводства и птицеводства.
Больше всего на себя обращают внимание фундаментальные и прикладные экологические проблемы, существующие в сельскохозяйственных регионах РФ, которые связаны с накоплением биологических и отходов жизнедеятельности от прошлых сельскохозяйственных работ. На загрязненных заброшенных территориях в первую очередь подвергаются существенной экологической опасности население, флора и фауна, включая домашних, сельскохозяйственных животных и птиц. Все это далее оказывает неблагоприятное влияние на эпизоотологическую и санитарно-эпидемиологическую обстановку сельских и городских населенных пунктов и природной среды, где обитают различные виды диких, домашних и сельскохозяйственных животных и птиц.
Известно, что последнее десятилетие сопровождается глобальными климатическими изменениями, которые приводят к резкой вариации погодных условий и далее способствуют уменьшению или нестабильности осадков в различных регионах РФ. В результате сокращения осадков происходит снижение эффективности и рентабельности многих отраслей сельского хозяйства.