В соответствии с Комплексной программой развития ФТС России на период до конца 2020 г. основной декларационный массив должен быть сконцентрирован в центрах электронного декларирования. В настоящее время во всех региональных таможенных управлениях, Калининградской областной, Московской областной и Шереметьевской таможнях функционируют 29 центров электронного декларирования (ЦЭД), на которые приходится около 22 % всего декларационного массива. При этом на ЦЭДах Сибирского, Уральского, Центрального и Северо-Кавказского таможенных управлений уже сейчас оформляется более 30 % всех деклараций соответствующего управления.
По своей сути центр электронного декларирования является специализированным таможенным органом, компетенция которого ограничивается совершением таможенных операций исключительно в электронной форме. Технологическим базисом его работы является технология удаленного выпуска, предусматривающая с использованием штатных программных средств электронное взаимодействие таможенных органов декларирования и места нахождения товара. Переход на обязательное электронное декларирование, внедрение электронного взаимодействия с федеральными органами исполнительной власти, обеспечение однократности представления электронных документов, автоматизация совершения таможенных операций, возможность представления документов на бумажных носителях в любой таможенный орган и целый ряд других мероприятий позволили исключить необходимость личного присутствия участника ВЭД при декларировании товаров.
В условиях постепенного перехода на цифровые технологии организация таможенного администрирования требует изменения структуры таможенных органов и концентрации декларирования товаров в специализированных таможенных органах, работающих только с электронными документами, — электронных таможнях и центрах электронного декларирования. В соответствии с одобренными Президентом и Правительством Российской Федерации планами в настоящее время проводятся работы по созданию 9 электронных таможен и 16 центров электронного декларирования: восьми региональных, двух областных, шести специализированных. Электронные таможни планируется создавать в тех же городах, что и региональные таможенные управления. В структуре электронной таможни предполагается создание центра электронного декларирования, который функционирует ежедневно в двенадцатичасовом режиме. В зависимости от внешнеэкономических характеристик региона, таких как объем товарооборота, наличие предприятий непрерывного цикла работы, возможно установление ЦЭДу круглосуточного режима работы. Приоритетным направлением проводимой работы является функционирование ЦЭДа в помещениях, находящихся в государственной собственности.