5 января 1902 года из Петербурга в Тамбов специальным поездом для погребения в Казанском мужском монастыре был привезен гроб с телом обер-камергера Императорского двора Э.Д. Нарышкина. На въезде в город была сооружена траурная арка с трогательной надписью «Просветителю народа — благодарный Тамбов». И это вполне справедливо. Несколько образовательно-воспитательных учреждений Тамбова были учреждены, построены и содержались на его личные средства.
В конце 1869 года Эммануил Дмитриевич отправляет уведомление в Губернскую земскую управу о намерении, в память умершей супруги Екатерины Николаевны, пожертвовать сумму для устройства в Тамбове учительского института. Для размещения института Э.Д. Нарышкиным было куплено за 25 000 рублей здание перемещенного в Воронеж Михайловского кадетского корпуса на улице Дубовой (ныне Карла Маркса). Для воспитания и полного содержания 36 учащихся института Э.Д. Нарышкиным был выделен капитал в 250 000 рублей. Впоследствии Эммануил Дмитриевич добавил к указанному вкладу еще 150 000 рублей. Передача здания «в вечное владение Екатерининскому институту» с надворными постройками и усадебным местом состоялась в сентябре 1901 года.
В январе 1876 года Э.Д. Нарышкин приступает к организации в Тамбове Александровского приюта для арестантских детей. Близ тюремного острога он покупает дом на Козловской улице (ныне Мичуринской) и, передав его в ведение Губернского тюремного комитета, на свои средства приступает к ремонту и переустройству здания для нужд приюта. Для поддержки его существования Эммануил Дмитриевич поместил в банк неприкосновенный капитал в 5000 рублей.
В 1874 году в Тамбове было учреждено «Общество для пособия нуждающимся воспитанникам Тамбовской гимназии и реального училища», которое обеспечивало бедных воспитанников учебниками, одеждой, обувью и, в случае необходимости, оказывало материальную помощь. Для них в 1879 году Эммануил Дмитриевич на личные средства осуществил устройство общежития на сорок человек на Гимназической улице (ныне Коммунальной), торжественная закладка которого была совершена 12 июня 1881 года. Постройка общежития стоила 50 000 рублей. Император Александр III удостоил Эммануила Дмитриевича звания пожизненного почетного председателя правления Общества и повелел именовать общежитие и стипендиатов «Нарышкинскими».