Рассматривая положения нового Таможенного кодекса Евразийского экономического союза, необходимо отметить, что в целом практически в полном объеме сохранены (остались без изменений) основные этапы процесса таможенного администрирования внешнеторговых грузов: прибытие товаров на таможенную территорию и убытие товаров с таможенной территории, применение таможенной процедуры таможенного транзита при перемещении товаров определенного статуса по таможенной территории Союза, временное хранение товаров под таможенным контролем, их таможенное декларирование и выпуск в соответствии с условиями заявляемых таможенных процедур, организация и проведение таможенного контроля. В то же время новое таможенное законодательство вносит достаточно много изменений, касающихся особенностей и сроков совершения таможенных операций, условий применения отдельных таможенных процедур.
В части таможенной процедуры таможенного транзита следует отметить, что в ТК ЕАЭС в целом сохранены ранее установленные требования, связанные с условиями применения данной процедуры, при перемещении иностранных товаров, а в отдельных установленных случаях и товаров Союза между различными таможенными органами. При этом необходимо сказать, что положениями ТК ЕАЭС предполагается необходимость применения таможенной процедуры таможенного транзита в отношении товаров Союза, помещенных под таможенную процедуру свободной таможенной зоны, перевозимых с одной территории СЭЗ на другую территорию СЭЗ в случае, если такие ОЭЗ находятся в разных государствах — членах Союза. Также необходимо обратить внимание на то, что, исходя из общего правила, товары Союза, помещенные под таможенную процедуру таможенного транзита, сохраняют статус товаров Союза, в том числе при их перемещении с одной части территории Союза на другую часть таможенной территории Союза через территорию государства, не являющегося членом Союза, за отдельным, но важным исключением. Так, если в рамках перемещения товаров Союза через территорию иностранного государства присутствует необходимость разгрузки, перегрузки, замена транспортного средства или совершение иных операций, предполагающих удаление средств таможенной идентификации, на территории государства, не являющегося членом Союза, то совершение таких операций должно осуществляться с разрешения таможенного органа, полученного до подачи транзитной декларации. В случае несоблюдения данного условия при прибытии товаров на таможенную территорию Союза они будут рассматриваться для таможенных целей как иностранные.