Геоэкологическое картографирование (ГЭК) является самым развивающимся и наиболее разветвленным направлением тематического картографирования. Это обусловлено, во‑первых, ростом внимания общества и государства к экологическим проблемам и соответственно спросом на пространственно распределенные сведения об экологическом состоянии от отдельных природных компонентов и небольших территорий до природных комплексов регионов и страны в целом, а во‑вторых, разнообразием взаимодействий систем природы и общества и образованием множества видов, уровней и состояний экосистем. Последнее обстоятельство нашло свое отражение в значительной дисциплинарной и отраслевой дифференцированности научного и прикладного разделов и, как следствие, в раздробленности экологической картографии. Это проявляется, в частности, в существовании различных направлений, школ и подходов картографирования, а также множества методик составления и сотни видов экологических карт. Очевидно, что отмеченная раздробленность экологической картографии не способствует взаимопониманию и взаимодействию специалистов, согласованному, а тем более системному созданию экологических карт и геоинформационных ресурсов, затрудняет применение стандартов и типовых геоинформационных технологий, распыляет материальные и человеческие ресурсы и в конечном счете препятствует формированию четко выстроенной программы исследований и решения экологических проблем.
По поводу раздробленности ГЭК Сладкопевцев С.А. писал [3]: «Отдавая должное авторам разработанных методик и созданных карт, следует отметить разнообразие приемов картографирования и весьма малую их согласованность, трудную сопоставленность содержания карт, отсутствие единой государственной стратегии ЭК территории РФ, что затрудняет решение многих вопросов природопользования и охраны природы на различных уровнях».
Однако Кочуров Б.Н. считает раздробленность ГЭК естественной, поскольку, по его мнению, данное направление по своей сути является не только исследовательским, но и поисковым, открывающим новые знания, которое не может основываться на единых методологии и методике, поэтому унификация ГЭК неприемлема [1]. Его мнение разделяет Струман В.Н., который считает, что разнообразие экологических карт «безгранично», равно как «безгранично» количество экологических ситуаций и соответственно подходов к их изучению [5].