Эдуард Михайлович родился 11 октября 1937 года. В 1960 году окончил геодезический факультет ГУЗ (в то время — МИИЗ).
На протяжении трех лет работал инженером-геодезистом в институте Гипросвязь.
С 1963 г. по 1971 г. — ассистент кафедры геодезии. С 1972 г. по 1977 г. он был командирован в гидротехнический институт Алжира для преподавания курса геодезии. Эдуард Михайлович разработал здесь комплекс методических пособий, написанных им на французском языке, которые актуальны и по сей день.
С 1977 года он — старший преподаватель, а с 2015 года — доцент кафедры геодезии и геоинформатики. На протяжении ряда лет был заместителем декана землеустроительного факультета по работе с иностранными студентами и по учебным практикам студентов. Более двадцати лет — Эдуард Михайлович неизменный руководитель всеми учебными практиками на НУБ «Чкаловский».
На кафедре геодезии и геоинформатики многие годы он являлся заместителем заведующего кафедрой по учебно-методической работе. Обладая особым педагогическим и учебно-методическим тактом, на высоком уровне читал лекции для студентов факультетов землеустройство и городской кадастр, вел практические занятия и организовывал учебные практики.
Эдуард Михайлович Ктиторов — автор и соавтор более 30 опубликованных методических пособий по выполнению студентами лабораторных, расчетно-графических, курсовых работ, проведению учебных практик по геодезии и геодезическим работам при землеустройстве. По результатам научных исследований им опубликована в учебном пособии «Геодезические работы при землеустройстве» (Недра, 1976 г.) и в «Справочнике по землеустройству» (Московский рабочий, 1975) глава «Геодезические работы, выполняемые при осуществлении противоэрозионной системы мероприятий».
Эдуард Михайлович Ктиторов награжден медалью «850-летие Москвы», нагрудным знаком «Отличник геодезии и картографии» (2004 г.) и почетной грамотой Министерства сельского хозяйства РФ (2005 г.) В 2012 году Э. М. Ктиторов был награжден серебряным нагрудным знаком Государственного университета по землеустройству.