Экосистема Волго-Каспийского бассейна в настоящее время подвергается интенсивной многофакторной антропогенной нагрузке, включающей в себя загрязнение промышленными и бытовыми стоками, последствия крупномасштабных морских геолого-разведочных работ, строительство гидротехнических сооружений. Из года в год данное влияние возрастает и приводит к перестройке биоценозов, существенному снижению их устойчивости и продуктивности [1; 2; 7; 16; 26].
Комплексное антропогенное воздействие существенно изменяет гидрологический, гидрохимический и гидробиологический режимы в Каспийском море. В целом подобное может привести к истощению минеральных и водных ресурсов. В свою очередь, происходит значительное влияние на среду обитания водных биологических ресурсов и, соответственно, на сами биоресурсы. При этом проходящие изменения влекут за собой смещение естественного равновесия флоры и фауны в сторону дисбаланса [10; 11; 14; 17; 27].
Санитарное состояние водоемов является одним из важнейших аспектов экологического благополучия изучаемой экосистемы. Для определения данного состояния проводят комплексные исследования, включающие в себя физико-химические, токсикологические, биологические и микробиологические методы. При этом именно последние дают информативную базу для прогнозирования не только санитарного, но и экологического состояния в рассматриваемом водоеме [3; 9; 12; 19].
Бактериоценоз относится к ключевому компоненту водной экосистемы, развитие которого определяется целым комплексом абиотических и биотических факторов. Постоянное антропогенное воздействие на водоем приводит к существенному изменению адаптационных механизмов населяющей его микробиоты. Зачастую все это сопровождается сменой количественного и качественного состава бактериоценоза исследуемого водоема с увеличением условно-патогенных микроорганизмов, которые могут персистировать в различных гидробионтах длительное время [4; 13; 20; 25]. Поэтому проведение микробиологических исследований является важным инструментом мониторинга и оценки санитарного состояния изучаемого водного объекта.