В соответствии с условиями договоров на строительство объектов заказчик ежемесячно, по фактически принятым объемам работ, проводит анализ документов на предмет соотношения твердой договорной цены работ (услуг) и фактически произведенных расходов, ведет накопительный учет отклонений в разрезе объектов капитального строительства. В накопительной ведомости учитываются суммы промежуточной (месячной) экономии или же фиксируются случаи отсутствия промежуточной (месячной) экономии. В случаях выявления экономии за отчетный период сторонами оформляется промежуточный протокол сложившейся экономии (или протокол отсутствия экономии). Удержание суммы экономии, причитающейся заказчику, оформляется сводным расчетом выявленной экономии (форма расчета согласована сторонами договора) и включается в справку о стоимости выполненных работ и затрат (форма КС-3) отчетного периода, оформленную после подписания сторонами акта о приемке выполненных работ (форма КС-2). В акте о приемке выполненных работ (форма КС-2) за каждый отчетный период отражается цена работ, предусмотренная договором подряда, согласно локальным сметам, без учета суммы доли экономии, распределенной в пользу заказчика. Счет-фактура выписывается на сумму справки о стоимости выполненных работ и затрат (форма КС-3), с учетом экономии подрядчика.
Окончательная сумма экономии либо ее отсутствие определяется только по завершении работ по договору (объекту) и оформляется сторонами протоколом о корректировке окончательных сумм расчетов (о наличии или отсутствии экономии) на основании подтверждающих документов, предоставленных подрядчиком. На основании протокола о корректировке окончательных сумм расчетов стороны подписывают дополнительное соглашение, в котором определяется окончательная цена работ по договору с учетом ее уменьшения на сумму доли экономии, распределенной в пользу заказчика.
В соответствии с нормами Налогового кодекса РФ счет-фактура выставляется к акту выполненных работ.