Согласно п. 15 ст. 165 НК РФ для подтверждения обоснованности применения налоговой ставки 0% и налоговых вычетов при реализации товаров (работ, услуг), предусмотренных отдельными подпунктами п. 1 ст. 164 НК РФ, налогоплательщик может представить в налоговый орган:
— реестры таможенных деклараций (полных таможенных деклараций) с указанием в них регистрационных номеров соответствующих деклараций вместо копий указанных деклараций;
— реестры документов, подтверждающих факт оказания услуг по транспортировке нефти и нефтепродуктов трубопроводным транспортом, документов, подтверждающих факт оказания услуг по организации транспортировки (услуг по транспортировке в случае ввоза на территорию Российской Федерации) природного газа трубопроводным транспортом, вместо копий указанных документов;
— реестры таможенных деклараций (полных таможенных деклараций), а также транспортных, товаросопроводительных и (или) иных документов вместо копий указанных документов;
— реестры транспортных, товаросопроводительных и (или) иных документов, реестр перевозочных документов вместо копий указанных документов;
— реестр перевозочных, товаросопроводительных или иных документов в электронной форме вместо реестра указанных документов на бумажном носителе.
Указанные реестры представляются в налоговый орган по установленному формату в электронной форме по телекоммуникационным каналам связи через оператора электронного документооборота, являющегося российской организацией и соответствующего требованиям, утвержденным федеральным органом исполнительной власти, уполномоченным по контролю и надзору в сфере налогов и сборов.
Налоговый орган, проводящий камеральную налоговую проверку, вправе истребовать у налогоплательщика документы, сведения из которых включены в реестры, указанные в настоящем пункте, с учетом следующих особенностей.
В рамках администрирования данного вопроса ФНС России выпустила письмо от 07.02.2017 № ЕД-4-15/2130@, где направила инспекциям контрольные соотношения по реестрам сведений, которые налогоплательщики подают для подтверждения нулевой ставки НДС. Данным письмом ФНС могут воспользоваться и налогоплательщики. В документе ФНС среди прочего содержатся 14 контрольных соотношений показателей форм реестров. Именно столько форм реестров налоговое ведомство утвердило еще в 2015 г.