Компьютерное моделирование — это бурно развивающийся научный метод, позволяющий прогнозировать ход и результат различных процессов за счет использования современных интеллектуальных технологий. Молекулярное моделирование (in silico) является одним из направлений компьютерного моделирования и широко используется в драг-дизайне. Такие методы, как quantitative structure-activity relationship (QSAR), quantitative structure-property relationship (QSPR), structure-activity relationship (SAR), молекулярный докинг, моделирование молекулярной динамики, позволяют выявить потенциальные биологически активные соединения и установить механизмы взаимодействия лигандов с мишенями. Разумеется, успешное прохождение эксперимента, смоделированного на компьютере, не может однозначно гарантировать дальнейшей судьбы биологически активной молекулы как лекарственного средства. И тем не менее благодаря применению молекулярного моделирования можно более четко определить потенциальную область использования соединений и оценить целесообразность проведения дальнейших исследований in vitro и in vivo.
Флавоноиды широко распространены в растительном мире. Данный класс представляет большой интерес для разработки лекарственных средств, поскольку многие представители семейства характеризуются антиоксидантными свойствами, широким спектром биологической активности и высоким профилем безопасности [1–3]. Этот класс соединений принято делить на 12 групп в соответствии со структурой молекулы (рис. 1).
Целью работы является определение тенденций применения методов in silico как инструмента первичного скрининга при создании лекарственных средств на базе флавоноидов.
Обзор выполнен на базе агрегатора научных публикаций Google Scholar в соответствии с рекомендациями PRISMA (Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and MetaAnalyses) [5]. Анализу подвергали статьи на русском и английском языках, опубликованные в период с 2016 по 2020 г. В поисковой стратегии использовали следующие ключевые слова: «флавоноид», «молекулярное моделирование», «хемоинформатика», «вычислительная химия», «компьютерное моделирование», «докинг», «молекулярная динамика». Поисковый запрос был сформирован с учетом законов алгебры логики на английском языке: («in silico» OR «molecular modelling» OR «cheminformatics» OR «computational chemistry» OR «molecular simulation» OR «computer simulation» OR «docking» OR «molecular dynamics») AND flavonoid; и русском: («молекулярное моделирование» OR «хемоинформатика» OR «докинг» OR «молекулярная динамика») AND флавоноид.