Современное развитие агропромышленного комплекса Российской Федерации во многом определяется внедрением инновационных технологий в аквакультуре, которая является одной из наиболее динамично развивающихся отраслей сельского хозяйства [2]. Рыбоводство играет ключевую роль в обеспечении продовольственной безопасности страны, особенно в условиях дефицита высококачественного животного белка и возрастающего спроса на экологически безопасные продукты питания. В связи с этим особую значимость приобретает изучение хозяйственно ценных видов рыб, характеризующихся высокой продуктивностью, устойчивостью к неблагоприятным факторам среды и способностью адаптироваться к условиям содержания. Приоритетными задачами отрасли являются не только наращивание объемов производства, но и обеспечение стабильного качества продукции, экономической эффективности и экологической устойчивости. Для достижения этих целей необходимо совершенствование селекционных программ на основе достоверных данных о генетическом разнообразии и эволюционных взаимоотношениях культивируемых форм.
Алтайский зеркальный карп (Cyprinus carpio L.) представляет собой один из важнейших объектов прудового рыбоводства Западной Сибири. Изучение его происхождения, биологических характеристик и генетической структуры имеет существенное значение для оптимизации селекционного процесса и повышения эффективности разведения. В последние годы особое развитие получило применение ДНК-маркеров для исследования генетического разнообразия, популяционной структуры и филогенетических отношений [9; 15; 16].
Актуальность настоящего исследования обусловлена необходимостью комплексного молекулярно-генетического анализа племенной группы алтайского зеркального карпа с целью выявления гаплотипического состава, оценки внутрипопуляционного полиморфизма и установления филогенетических связей с другими подвидами и породами рода Cyprinus. Особое внимание уделяется анализу фрагмента гена цитохромоксидазы I (COX1) митохондриальной ДНК (мтДНК), который является одним из наиболее информативных и широко применяемых маркеров для изучения эволюционных и популяционных процессов у гидробионтов [13]. МтДНК обладает рядом уникальных свойств, включая материнский тип наследования, отсутствие рекомбинации и высокую скорость накопления мутаций, что делает ее ценным инструментом для реконструкции филогенетических отношений и выявления скрытого генетического разнообразия внутри пород и популяций [4; 5].