Контроль — одна из основных функций управления [7, с. 146]. Основной функцией контроля в сфере управления общественными финансами является осуществление контроля за расходованием средств и материальных ценностей, их хранением, состоянием и достоверностью бухгалтерского учета и финансовой отчетности [6].
Переориентация системы управления общественными финансами с работы на процесс, на работу на результат является одной из приоритетных в России [3]. В организациях государственного сектора это проявляется в смещении приоритетов с выполнения процедур на достижение результатов осуществления финансового менеджмента.
Международный опыт внедрения системы внутреннего контроля в организациях государственного сектора начинается с середины XX века [5, с. 4]. В России же внедрение системы внутреннего контроля в государственном секторе началась намного позже.
В стандарте Международной организации высших контрольных органов в сфере государственных финансов INTOSAI (Intеrnational Organization of Supreme Audit Institutions) внутренний контроль понимается как комплексный процесс, способствующий минимизации рисков, в котором участвуют как руководство, так и сотрудники организации. Также внутренний контроль предоставляет гарантию того, что ведение деятельности будет осуществляться упорядоченным, этичным, экономичным, эффективным и результативным способом, будут исполнены обязательства подотчетности, будут соблюдены законодательство и инструкции, а также ресурсы будут защищены от угроз (утраты, нецелевого использования и повреждения) [8, p. 6].
В стандарте Комитета спонсорских организаций Комиссии Тредуэя COSO (Committee of Sponsoring Organizations of the Treadway Commission) внутренний контроль понимается как процесс, направленный на обеспечение разумной уверенности в достижении целей операционной деятельности, подготовки отчетности и соблюдение законодательства, в котором участвуют совет директоров, менеджмент и другой персонал [9, p. 3].
В системе здравоохранения из четырех форм контроля (контроль качества и безопасности медицинской деятельности, государственный контроль (надзор) в сфере обращения лекарственных средств, государственный контроль за обращением медицинских изделий, федеральный государственный санитарно-эпидемиологический надзор) только контроль качества и безопасности медицинской деятельности включает в себя внутренний контроль.