По всем вопросам звоните:

+7 495 274-22-22

УДК: 616.8-338.27:004 DOI:10.33920/med-01-2412-15

Использование методов сегментации на базе технологий искусственного интеллекта для построения трехмерных моделей

Иванов Владимир Михайлович д-р физ.-мат. наук, профессор Высшей школы теоретической механики и математической физики Федерального государственного автономного образовательного учреждения высшего образования «Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого», Россия, г. Санкт-Петербург, voliva@rambler.ru, +7 921 914 0989, ORCID ID: 0000–0001–5956–2306
Князев Александр Викторович руководитель направления «Лучевая диагностика», ООО «Нацстандарт-дистрибуция», Россия, г. Москва, Alexander.knyazev@mail.ru, +7 985 334 2162, ORCID ID: 0009-0000-2111-382X
Стрелков Сергей Васильевич технический директор, ООО «Меджитал», Россия, г. Санкт-Петербург, sergin3d2d@gmail.com, +79030969273, ORCID ID: 0000-0002-5901-0866
Синегуб Андрей Владимирович кандидат технических наук, специалист Высшей школы теоретической механики и математической физики Федерального государственного автономного образовательного учреждения высшего образования «Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого», Россия, г. Санкт-Петербург, a.sinegub@yandex.ru, +79818476730, ORCID ID: 0000-0003-2619-3691
Смирнов Антон Юрьевич студент кафедры системного анализа и оптимизации информационных систем и технологий Федерального государственного автономного образовательного учреждения высшего образования «Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого», Россия, г. Санкт-Петербург, ishunpo0@gmail.com, +7 999 008 6951, ORCID ID: 0009-0001-2440-2499

Технологии виртуальной реальности, дополненной реальности и смешанной реальности становятся всё более популярными в медицине, включая нейрохирургию и лечение травм. Компания «Меджитал» создала систему «Меджитал Вижн», которая позволяет хирургам видеть внутренности пациента в 3D во время операции с помощью специальных очков. Однако перед операцией необходимо подготовить 3D-модель, что занимает время. Чтобы ускорить этот процесс, предлагается использовать автоматическую сегментацию с помощью искусственного интеллекта. Исследование направлено на анализ существующих архитектур нейросетей и открытых решений для этой задачи.

Литература:

1. Mantovani F. et al. Virtual reality training for health-care professionals // CyberPsychology & Behavior. 2003. Vol. 6. № 4. PP. 389–395.

2. Halabi O. et al. Virtual and augmented reality in surgery //The Disruptive Fourth Industrial Revolution: Technology, Society and Beyond. 2020. PP. 257–285.

3. Fodor L.A. et al. The effectiveness of virtual reality-based interventions for symptoms of anxiety and depression: A metaanalysis //Scientific reports. 2018. Vol. 8. № 1. P. 10323.

4. Lange B., Flynn S., Rizzo A. Initial usability assessment of off-the-shelf video game consoles for clinical game-based motor rehabilitation //Physical Therapy Reviews. 2009. Vol. 14. № 5. PP. 355–363.

5. Gold J. I. et al. Effectiveness of virtual reality for pediatric pain distraction during iv placement //CyberPsychology & Behavior. 2006. Vol. 9. № 2. PP. 207–212.

6. Gerardi M. et al. Virtual reality exposure therapy for post-traumatic stress disorder and other anxiety disorders //Current psychiatry reports. 2010. Vol. 12. PP. 298–305.

7. Matthews J.H., Shields J.S. The clinical application of augmented reality in orthopaedics: where do we stand? //Current Reviews in Musculoskeletal Medicine. 2021. Vol. 14 № 5 PP. 316–319.

8. de Farias Macedo M.C. et al. High-quality on-patient medical data visualization in a markerless augmented reality environment //Journal on Interactive Systems. 2014. Vol. 5. № 3. PP. 41–52.

9. Дороничева А.В., Савин С. З. Метод сегментации медицинских изображений //Фундаментальные исследования. 2015. № 5–2. С. 294–298.

10. Родзин С.И., Аднан Э.Х. С. Совершенствование алгоритмов сегментации магнитно-резонансных изображений на основе роевого интеллекта //Вестник Чувашского университета. 2016. № 3. С. 217–226.

11. Tingelhoff K., Moral A. I., Kunkel M. E., Bootz F. Analysis of manual segmentation in medical image processing //European Archives of Oto-Rhino-Laryngology. 2008. Vol. 265, Issue 9. PP. 1061–1070.

12. Jardim S., António J., Mora C. Image thresholding approaches for medical image segmentation-short literature review // Procedia Computer Science. 2023. Vol. 219. PP. 1485–1492.

13. Tak R. et al. Segmentation of medical image using region based statistical model //2017 International Conference on Intelligent Computing and Control Systems (ICICCS). IEEE, 2017. PP. 1247–1253.

14. Karthicsonia B., Vanitha M. Edge based segmentation in medical images //International Journal of Engineering and Advanced Technology. 2019. Vol. 9. № 1. PP. 449–451.

15. Kavitha A.R., Chellamuthu C. Implementation of gray-level clustering algorithm for image segmentation //Procedia Computer Science. 2010. Vol. 2. PP. 314–320.

16. Seo H. et al. Machine learning techniques for biomedical image segmentation: an overview of technical aspects and introduction to state‐of‐art applications //Medical physics. 2020. Vol. 47. № 5. PP. e148-e167.

17. Козлова, О. В., Куница, Е. Ю., Лукашевич, М.М. U-net для решения задачи сегментации медицинских изображений// Пятая Международная научно-практическая конференция «BIG DATA and Advanced Analytics. BIG DATA и анализ высокого уровня», Минск, Республика Беларусь, 13–14 марта 2019 года.

18. Ronneberger O., Fischer P., Brox T. U-net: Convolutional networks for biomedical image segmentation //Medical image computing and computer-assisted intervention — MICCAI 2015: 18th international conference, Munich, Germany, October 5–9, 2015, proceedings, part III 18. Springer International Publishing. 2015. PP. 234–241.

19. Zhou Z. et al. Unet++: A nested u-net architecture for medical image segmentation //Deep Learning in Medical Image Analysis and Multimodal Learning for Clinical Decision Support: 4th International Workshop, DLMIA 2018, and 8th International Workshop, ML–CDS 2018, Held in Conjunction with MICCAI 2018, Granada, Spain, September 20, 2018, Proceedings 4. Springer International Publishing, 2018. PP. 3–11.

20. Isensee F. et al. nnu-net: Self-adapting framework for u-net-based medical image segmentation //arXiv preprint arXiv:1809.10486. 2018.

21. Jha D. et al. Resunet++: An advanced architecture for medical image segmentation //2019 IEEE international symposium on multimedia (ISM). IEEE, 2019. PP. 225–2255.

22. Dong H. et al. Automatic brain tumor detection and segmentation using U-Net based fully convolutional networks //Medical Image Understanding and Analysis: 21st Annual Conference, MIUA 2017, Edinburgh, UK, July 11–13, 2017, Proceedings 21 Springer International Publishing. 2017. PP. 506–517.

23. van Harten L.D. et al. Automatic Segmentation of Organs at Risk in Thoracic CT scans by Combining 2D and 3D Convolutional Neural Networks //SegTHOR@ ISBI. 2019. Vol. 2019. PP. 139099960.

24. Dosovitskiy A. et al. An image is worth 16x16 words: Transformers for image recognition at scale //arXiv preprint arXiv:2010.11929. 2020.

25. He K. et al. Transformers in medical image analysis //Intelligent Medicine. 2023. Vol. 3. № 1. PP. 59–78.

26. Zheng Y. et al. A graph-transformer for whole slide image classification //IEEE transactions on medical imaging. 2022. Vol. 41. №. 11. PP. 3003–3015.

27. Sourget T. et al. Can SegFormer be a True Competitor to U-Net for Medical Image Segmentation? //Annual Conference on Medical Image Understanding and Analysis. Cham: Springer Nature Switzerland. 2023. PP. 111–118.

28. Jia X. et al. U-net vs transformer: Is u-net outdated in medical image registration? //International Workshop on Machine Learning in Medical Imaging. Cham: Springer Nature Switzerland. 2022. PP. 151–160.

29. Kirillov A. et al. Segment anything //Proceedings of the IEEE/CVF International Conference on Computer Vision. 2023. PP. 4015–4026.

30. Sofiiuk K., Petrov I.A., Konushin A. Reviving iterative training with mask guidance for interactive segmentation //2022 IEEE International Conference on Image Processing (ICIP). 2022. PP. 3141–3145.

31. Lüddecke T., Ecker A. Image segmentation using text and image prompts //Proceedings of the IEEE/CVF conference on computer vision and pattern recognition. 2022. PP. 7086–7096.

32. Bui N.T. et al. Sam3d: Segment anything model in volumetric medical images //arXiv preprint arXiv:2309.03493. 2023.

Виртуальная (VR), дополненная (AR) и смешанная реальность (MR) применяется в различных областях медицины, включая обучение, диагностику, реабилитацию и психотерапию.

VR предоставляет студентам возможность изучать анатомию и выполнять процедуры на 3D-модели человеческого тела неинвазивно, без использования других методов диагностики и визуализации [1].

С помощью VR/AR/MR врачи могут выполнять предоперационное планирование сложных операций, улучшая понимание анатомии пациента путем анализа виртуальных моделей органов, полученных с помощью МРТ, КТ [2].

Виртуальная реальность используется для лечения различных фобий, тревожных расстройств путем симулирования ситуаций, вызывающих тревогу в безопасной среде. Например, люди с фобией высоты могут использовать VR-очки для постепенного привыкания к высоте [3].

Виртуальная реальность помогает пациентам выполнять упражнения для восстановления двигательных навыков и координации для реабилитации после травм, инсультов или других повреждений [4].

VR также используется для отвлечения внимания пациентов от боли и снижения уровня стресса во время лечения или послеоперационного периода [5].

Виртуальная реальность помогает пациентам с ПТСР постепенно преодолевать расстройство путем симуляции сценариев, вызывающих его [6].

AR/MR используются для предоставления хирургам во время операций информации о внутренних структурах тела пациента. Например, с помощью AR-очков хирург видит виртуальные указатели и инструкции прямо в поле зрения во время процедуры, что помогает улучшить точность и эффективность вмешательства [7].

С помощью AR/MR проводят визуализацию данных прямо на пациенте для оптимизации процесса постановки диагноза [8].

Вся подготовка к операции происходит за пределами операционной, что не влияет на время проведения хирургического вмешательства. Однако специалистам требуется время и специальные знания для подготовки 3D-моделей для операции при помощи сегментации.

Сегментация медицинских данных — это процесс обработки DICOM изображений путем распознавания отдельных элементов на изображении, разделение его на сегменты для упрощения его представления [9]. В зависимости от поставленной задачи выбирается количество классов, на которое надо разбить изображение, и каждой минимальной единице изображения (пиксель, воксель) присваивается тот или иной класс в рамках зоны интереса в соответствии с условием поставленной задачи (например, выделение костей, опухоли и сосудов) [10].

Для Цитирования:
Иванов Владимир Михайлович, Князев Александр Викторович, Стрелков Сергей Васильевич, Синегуб Андрей Владимирович, Смирнов Антон Юрьевич, Использование методов сегментации на базе технологий искусственного интеллекта для построения трехмерных моделей. Вестник неврологии, психиатрии и нейрохирургии. 2024;12.
Полная версия статьи доступна подписчикам журнала
Язык статьи:
Действия с выбранными: