Развал государственной экономики в конце 80‑х гг. прошлого столетия и прекращение государственной поддержки сельского хозяйства в прежних объемах в течение длительного времени до принятия первой Государственной программы развития сельского хозяйства и регулирования рынков сельскохозяйственной продукции, сырья и продовольствия на 2008–2012 годы сильнее всего ударил по сельскохозяйственной отрасли Нечерноземья с ее невысоким агроклиматическим потенциалом, низкоурожайными подзолистыми и серыми лесными почвами и малопродуктивным молочным производством, низким технико-технологическим уровнем ведения сельскохозяйственного производства, не соответствующим мировому уровню, высокой импортозависимостью по таким видам ресурсов, как семена, средства защиты растений, кормовые добавки, ветеринарные препараты и т.п.
В связи со значительно более высокими темпами увеличения затрат на приобретение материальных ресурсов промышленного производства по сравнению с ростом цен на сельскохозяйственную продукцию и уменьшением доходности сельхозпроизводства резко сократилось применение минеральных удобрений, что, с учетом значительного сокращения поголовья крупного рогатого скота и снижения внесения в почву органических удобрений, привело к усилению повсеместного истощительного использования плодородия почв и их деградации.
В структуре затрат на производство сельскохозяйственной продукции в 2,4 раза снизилась доля оплаты труда с 38,5 % в 1991 г. до 16,2 % в 2017 г., что сказалось на снижении качества жизни семей сельскохозяйственных работников.
Доля амортизационных отчислений в 2017 г. по сравнению с 1990 г. уменьшилась с 12,2 до 9,4 % на 2,8 % (30 %), что привело к продолжению многими средними и особенно мелкими сельхозтоваропроизводителями примитивных технологий и технических средств, сдерживанию перехода на использование ресурсосберегающих технологий, современных машин и оборудования. Доля импортной техники в общей структуре сельскохозяйственной техники в 2017 г. составила по тракторам 69 %, по машинам и оборудованию для животноводства около 90 %. Из-за инвестиционной недостаточности темпы технико-технологического обновления сельскохозяйственной техники низкие. Коэффициент обновления составляет всего лишь 4 %, средний срок ее эксплуатации почти четверть века. Темпы ее выбытия почти в 2 раза выше приобретения новой, имеющийся парк сельскохозяйственной техники существенно ниже необходимого для ведения эффективного сельскохозяйственного производства1.