С самого первого дня войны коллектив преподавателей, сотрудников, студентов и аспирантов Московского инженерно-строительного института (тогда МИСИ им. В.В. Куйбышева) откликнулся на всеобщий призыв к защите Родины. С первых же дней ежедневно в порядке мобилизации и добровольно из института уходили на фронт преподаватели, сотрудники, студенты, аспиранты. В такой обстановке 270 выпускников 1941 года получили дипломы инженеров без защиты дипломных проектов и сразу же оказались на самых сложных участках фронта. В первую же неделю в полном составе ушли в армию члены кафедры физической подготовки. Многие преподаватели откомандировывались на строительство объектов оборонного значения, позже — на восстановление предприятий. В общей сложности за второе полугодие 1941 года МИСИ послал на сооружение оборонительных рубежей около 1000 человек. На нужды фронта была перестроена научно-исследовательская работа ученых МИСИ. Приказом по институту от 30 июля 1941 года 44 преподавателя были направлены на работу в различные ведомства: в «Спецгидрострой», «Стальконструкцию», Военно-инженерную академию, на завод по производству готовых конструкций для фортификационных сооружений и др. Заведующий кафедрой строительных материалов проф. Н. А. Попов вместе со своими аспирантами и ассистентами был направлен в Центральную научно-исследовательскую лабораторию Наркомстроя. На основе экспериментальных данных ими был разработан способ по бутовой кладке высокой прочности, пригодной для бомбоубежищ и полевых фортификаций. Проф. кафедры канализации Я. А. Карелин всю войну работал в системе Управления особого строительства Наркомата обороны.
В первые дни войны институт вынужден был передать свои учебные здания под госпиталь, а общежитие — военному ведомству. В связи с этим производился демонтаж лабораторий и мастерских. Моссовет выделил МИСИ школьные здания в Ленинском и Москворецком районах. Несмотря на всю сложность военной обстановки сентября 1941 года, в нашем вузе начался новый учебный год. На всех факультетах и отделениях осталось 665 студентов. Учебный процесс был нарушен через полтора месяца, когда в середине октября Москва была объявлена на осадном положении и началась эвакуация учреждений, предприятий, учебных заведений и жителей столицы.