Важной задачей селекционно-племенного дела в рыбоводстве является сохранение и улучшение генофонда культивированных видов [1, 2]. Обеспечение рыбохозяйственных предприятий качественным племенным материалом растительноядных видов рыб требует постоянного генетического контроля, который предоставит возможность выявить видоспецифические характеристики генофондов, особенности дрейфа генов от предковой популяции, влияния условий воспроизведения. Основой такой работы являются генетические исследования, которыми ранее установлено, что маточные стада белого толстолобика были представлены помесями амурской и китайской линий, выявлялись также и межвидовые гибриды белого и пестрого толстолобиков. Недооценивание важности селекционно-генетических работ при освоении новых объектов выращивания, а также недостаточный контроль при формировании маточных стад акклиматизированных видов приводят к образованию гибридов и снижению плодовитости производителей [2]. Поэтому важным заданием при воспроизводстве растительноядных рыб является восстановление чистоты каждого вида и решение проблемы сохранения их внутривидовой гетерогенности [2]. Сохранение на достаточно высоком уровне генетического разнообразия сельскохозяйственных видов является важным для эффективного ведения селекционной работы в направлении повышения адаптивности пород [3].
Отдельными авторами описаны разные типы молекулярно-генетических маркеров, незаменимые при проведении генетического мониторинга племенных стад рыб, выявления диапазона популяционной и видовой изменчивости, изучения филогенеза, степени генетической схожести и последующей микроэволюции видов [4]. Российскими авторами отмечалась возможность использования фракционного состава альбумина и трансферрина в качестве биохимических маркеров при проведении генетического мониторинга маточных стад с целью уменьшения влияния негативных последствий искусственного воспроизведения на генетическую структуру белого и пестрого толстолобиков [5, 6]. Белорусскими исследователями изучена генеалогическая разнокачественность китайской и амурской линий белого толстолобика, отличающихся по частотам аллелей эритроцитарной глюкозо-6-фосфатдегидрогеназы [7]. Проведено сравнение генотипического состава белковых систем толстолобиков вьетнамского и китайского происхождения, что предоставило возможность установить видоспецифичность локуса супероксиддисмутазы [8]. В некоторых литературных источниках указывается о возрастной изменчивости частот аллелей белковых локусов у белого толстолобика. Отмечается, что такие изменения связаны с адаптацией к условиям разведения и происходят под контролем не только искусственного, но и естественного отборов [9]. Описаны особенности генетической изменчивости толстолобиков с использованием микросателлитных маркеров [10].