По всем вопросам звоните:

+7 495 274-22-22

УДК: 615.013 DOI:10.33920/med-03-2312-07

Флуоресцентные белки в оптическом имиджинге

Пешкова Яна Алексеевна студентка кафедры фармакологии Института фармации имени А.П. Нелюбина, федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Первый МГМУ имени И.М. Сеченова» Минздрава России (Сеченовский университет), направление подготовки 06.04.01 Биология, профиль «Инновационные лекарственные средства»
Завадский Сергей Павлович канд. фарм. наук, доцент кафедры фармакологии Института фармации имени А.П. Нелюбина, федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Первый МГМУ имени И.М. Сеченова» Минздрава России (Сеченовский университет) (119048, г. Москва, ул. Трубецкая, д. 8, стр. 2), г. Москва, пр-т Вернадского, д. 96, к. 1, е-mail: zavadskiy_s_p@staff.sechenov.ru, 8-903-611-13-10, ORCID: 0000-0002-1607-9118

Активно развивающиеся в последние годы технологии оптического биоимиджинга, в том числе флуоресцентной микроскопии, позволили визуализировать многие биологические процессы. Одним из важнейших инструментов изучения клеточных и тканевых структур являются флуоресцентные маркеры, которые дают возможность проводить наблюдение за структурами или процессами в режиме реального времени. Авторами проведено обзорное исследование описанных флуоресцентных белков и области их применения, сделаны выводы о дальнейшей перспективе их использования.

Литература:

1. Iftimia N., Brugge W.R., Hammer D.X. Advances in Optical Imaging for Clinical Medicine // Advances in Optical Imaging for Clinical Medicine/под ред. Iftimia N., Brugge W.R., Hammer D.X. Hoboken, NJ, USA: John Wiley & Sons, Inc., 2011.

2. Соловьева А.О., Зубарева К.Э., Повещенко А.Ф., Нечаева Е.А. К. В.И. Способы мечения клеток для визуализации in vivo. Гены и клетки. Публичное акционерное общество «Институт стволовых клеток человека», 2013; 8, 4.

3. Tong L. и др. Current Perspectives on Molecular Imaging for Tracking Stem Cell Therapy // Medical Imaging in Clinical Practice. InTech, 2013.

4. Степаненко О.В., Верхуша В.В., Кузнецова И.М. Т. К.К. Флуоресцентные белки: физико-химические свойства и использование в клеточной биологии. Цитология. 2007; 49, 5: 395-420.

5. Heim R., Prasher D.C., Tsien R.Y. Wavelength mutations and posttranslational autoxidation of green fluorescent protein. Proc. Natl. Acad.Sci. U. S.A. National Academy of Sciences, 1994; 91, 26: 12501-12504.

6. Reid B.G., Flynn G.C. Chromophore Formation in Green Fluorescent Protein. Biochemistry. 1997; 36, 22: 6786-6791.

7. Cubitt A.B. и др. Understanding, improving and using green fluorescent proteins. Trends Biochem. Sci. Trends Biochem Sci, 1995; 20, 11: 448-455.

8. Tsien R.Y. The green fluorescent protein. Annual Review of Biochemistry. Annu Rev Biochem, 1998; 67: 509-544.

9. Nicol D.D. and J.A. C. Luminescence in Hydromedusae. Proc.R. Soc. London. Ser. B — Biol.Sci. The Royal Society, 1955; 144, 916: 399-411.

10. Зубова Н.Н., Булавина А.Ю. С. А.П. Спектральные и физико-химические свойства зеленого (GFP) и красного (drfp583) флуоресцирующих белков. Успехи биологической химии. 2003; 43: 163-224.

11. Prasher D.C. и др. Primary structure of the Aequorea victoria green-fluorescent protein. Gene. Gene, 1992; 111, 2: 229-233.

12. ZEISS Microscopy Online Campus. Jellyfish Fluorescent Proteins [Электронный ресурс]. URL: http:// zeiss-campus.magnet.fsu.edu/articles/probes/jellyfishfps.html (дата обращения: 26.10.2020).

13. Remington S.J. Green fluorescent protein: A perspective. Protein Sci. Wiley-Blackwell, 2011; 20, 9: 1509-1519.

14. Craggs T.D. Green fluorescent protein: Structure, folding and chromophore maturation. Chem.Soc. Rev. Chem Soc Rev, 2009; 38, 10: 2865-2875.

15. Cody C.W. и др. Chemical Structure of the Hexapeptide Chromophore of the Aequorea Green-Fluorescent Protein. Biochemistry. Biochemistry, 1993; 32, 5: 1212-1218.

16. Molecular Expressions: Science, Optics, and You: Light and Color — Sources of Visible Light [Электронный ресурс]. URL: https://micro.magnet.fsu.edu/optics/lightandcolor/sources. html (дата обращения: 26.10.2020).

17. From Fluorophores to Filters: A guide to Fluorescence Microscopy [Электронный ресурс]. URL: https://bitesizebio.com/33529/fluorescence-microscopy-the-magic-of-fluorophores-and-filters/(дата обращения: 26.10.2020).

18. Lichtman J.W., Conchello J.A. Fluorescence microscopy. Nature Methods. 2005; 2, 12: 910-919.

19. Шемякина И.И. Красные и дальне-красные флуоресцентные белки, оптимизированные для мечения белков слияния, 2015.

20. Shaner N.C., Steinbach P.A., Tsien R.Y. A guide to choosing fluorescent proteins. Nat. Methods. Nat Methods, 2005; 2, 12: 905-909.

21. Cormack B.P., Valdivia R.H., Falkow S. FACS-optimized mutants of the green fluorescent protein (GFP). Gene. Elsevier B.V., 1996; 173, 1: 33-38.

22. Barondeau D.P. и др. Structural chemistry of a green fluorescent protein Zn biosensor. J.Am. Chem. Soc. J Am Chem Soc, 2002; 124, 14: 3522-3524.

23. Лукьянов С.А. Флуоресцентные белки: природное разнообразие и применение в биомедицинских исследованиях (актовая речь РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России), 2013; 74 с.

24. Piatkevich K.D., Verkhusha V.V. Guide to red fluorescent proteins and biosensors for flow cytometry. Methods in Cell Biology. Methods Cell Biol, 2011; 102: 431-461.

25. Böhm I. и др. Monitoring of tumor burden in vivo by optical imaging in a xenograft SCID mouse model: evaluation of two fluorescent proteins of the GFP-superfamily. Acta radiol. SAGE Publications Inc., 2019; 60, 3: 315-326.

26. Terai T., Nagano T. Small-molecule fluorophores and fluorescent probes for bioimaging. Pflugers Arch.Eur. J. Physiol. Pflugers Arch, 2013; 465, 3: 347-359.

27. Chalfie M. GFP: Lighting up life. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Proc Natl Acad Sci U S A, 2009; 106, 25: 10073-10080.

28. Yuste R. Fluorescence microscopy today. Nat. Methods. Nat Methods, 2005; 2, 12: 902-904.

29. Komorowski M., Finkenstädt B., Rand D. Using a single fluorescent reporter gene to infer half-life of extrinsic noise and other parameters of gene expression. Biophys. J. Biophysical Society, 2010; 98, 12: 2759-2769.

30. File: Dividing Cell Fluorescence. jpg — Wikimedia Commons [Электронный ресурс]. URL: https:// commons.wikimedia.org/wiki/File: Dividing_Cell_Fluorescence. jpg (дата обращения: 26.10.2020).

31. Щербо Д.С. Дальнекрасные флуоресцентные белки. 2010.

32. Kouros-Mehr H. и др. GATA-3 Links Tumor Differentiation and Dissemination in a Luminal Breast Cancer Model. Cancer Cell. Cancer Cell, 2008; 13, 2: 141-152.

33. Photoactivatable, photoconvertible, and photoswitchable Fluorescent Proteins | Learn & Share | Leica Microsystems [Электронный ресурс]. URL: https://www.leica-microsystems.com/science-lab/photoactivatable-photoconvertible-and-photoswitchable-fluorescent-proteins/(дата обращения: 26.10.2020).

34. Zhou X.X., Lin M.Z. Photoswitchable fluorescent proteins: Ten years of colorful chemistry and exciting applications. Curr. Opin. Chem. Biol. NIH Public Access, 2013; 17, 4: 682-690.

35. Ando R. и др. An optical marker based on the UV-induced green-to-red photoconversion of a fluorescent protein. Proc. Natl. Acad.Sci. U. S. A., 2002; 99, 20: 12651-12656.

1. Iftimia N., Brugge W.R., Hammer D.X. Advances in Optical Imaging for Clinical Medicine // Advances in Optical Imaging for Clinical Medicine/eds. Iftimia N., Brugge W.R., Hammer D.X. Hoboken, NJ, USA: John Wiley & Sons, Inc., 2011.

2. Solovieva A.O., Zubareva K.E., Poveshchenko A.F., Nechaeva E.A. K. V.I. Sposoby mecheniia kletok dlia vizualizatsii in vivo. Geny i kletki [Methods for labeling cells for in vivo imaging. Genes and cells]. Public Joint Stock Company «Human Stem Cell Institute», 2013; 8, 4. (In Russ.)

3. Tong L. et al. Current Perspectives on Molecular Imaging for Tracking Stem Cell Therapy // Medical Imaging in Clinical Practice. InTech, 2013.

4. Stepanenko O.V., Verkhusha V.V., Kuznetsova I.M. T. K.K. Fluorestsentnye belki: fiziko-khimicheskie svoistva i ispolzovanie v kletochnoi biologii [Fluorescent proteins: physicochemical properties and use in cell biology]. Tsitologiia [Cytology]. 2007; 49, 5: 395-420. (In Russ.)

5. Heim R., Prasher D.C., Tsien R.Y. Wavelength mutations and posttranslational autoxidation of green fluorescent protein. Proc. Natl. Acad.Sci. U. S.A. National Academy of Sciences, 1994; 91, 26: 12501-12504.

6. Reid B.G., Flynn G.C. Chromophore Formation in Green Fluorescent Protein. Biochemistry. 1997; 36, 22: 6786-6791.

7. Cubitt A.B. et al. Understanding, improving and using green fluorescent proteins. Trends Biochem. Sci. Trends Biochem Sci, 1995; 20, 11: 448-455.

8. Tsien R.Y. The green fluorescent protein. Annual Review of Biochemistry. Annu Rev Biochem, 1998; 67: 509-544.

9. Nicol D.D. and J.A. C. Luminescence in Hydromedusae. Proc.R. Soc. London. Ser. B — Biol.Sci. The Royal Society, 1955; 144, 916: 399-411.

10. Zubova N.N., Bulavina A.Iu. S. A.P. Spektralnye i fiziko-khimicheskie svoistva zelenogo (GFP) i krasnogo (drfp583) fluorestsiruiushchikh belkov [Spectral and physicochemical properties of green (GFP) and red (drfp583) fluorescent proteins]. Uspekhi biologicheskoi khimii [Advances in Biological Chemistry]. 2003; 43: 163-224. (In Russ.)

11. Prasher D.C. et al. Primary structure of the Aequorea victoria green-fluorescent protein. Gene. Gene, 1992; 111, 2: 229-233.

12. ZEISS Microscopy Online Campus. Jellyfish Fluorescent Proteins [Electronic resource]. URL: http:// zeiss-campus.magnet.fsu.edu/articles/probes/jellyfishfps. html (accessed: 26.10.2020).

13. Remington S.J. Green fluorescent protein: A perspective. Protein Sci. Wiley-Blackwell, 2011; 20, 9: 1509-1519.

14. Craggs T.D. Green fluorescent protein: Structure, folding and chromophore maturation. Chem.Soc. Rev. Chem Soc Rev, 2009; 38, 10: 2865-2875.

15. Cody C.W. et al. Chemical Structure of the Hexapeptide Chromophore of the Aequorea Green-Fluorescent Protein. Biochemistry. Biochemistry, 1993; 32, 5: 1212-1218.

16. Molecular Expressions: Science, Optics, and You: Light and Color — Sources of Visible Light [Electronic resource]. URL: https://micro.magnet.fsu.edu/optics/lightandcolor/sources.html (accessed: 26.10.2020).

17. From Fluorophores to Filters: A guide to Fluorescence Microscopy [Electronic resource]. URL: https:// bitesizebio.com/33529/fluorescence-microscopy-the-magic-of-fluorophores-and-filters/(accessed: 26.10.2020).

18. Lichtman J.W., Conchello J.A. Fluorescence microscopy. Nature Methods. 2005; 2, 12: 910-919.

19. Shemyakina I.I. Krasnye i dalne-krasnye fluorestsentnye belki, optimizirovannye dlia mecheniia belkov sliianiia [Red and far-red fluorescent proteins optimized for tagging fusion proteins], 2015. (In Russ.)

20. Shaner N.C., Steinbach P.A., Tsien R.Y. A guide to choosing fluorescent proteins. Nat. Methods. Nat Methods, 2005; 2, 12: 905-909.

21. Cormack B.P., Valdivia R.H., Falkow S. FACS-optimized mutants of the green fluorescent protein (GFP). Gene. Elsevier B.V., 1996; 173, 1: 33-38.

22. Barondeau D.P. et al. Structural chemistry of a green fluorescent protein Zn biosensor. J.Am. Chem. Soc. J Am Chem Soc, 2002; 124, 14: 3522-3524.

23. Lukianov S.A. Fluorestsentnye belki: prirodnoe raznoobrazie i primenenie v biomeditsinskikh issledovaniiakh (aktovaia rech RNIMU im. N.I. Pirogova Minzdrava Rossii) [Fluorescent proteins: natural diversity and application in biomedical research (commencement address of the N.I. Pirogov Russian National Research Medical University of the Ministry of Health of Russia)], 2013; 74 p. (In Russ.)

24. Piatkevich K.D., Verkhusha V.V. Guide to red fluorescent proteins and biosensors for flow cytometry. Methods in Cell Biology. Methods Cell Biol, 2011; 102: 431-461.

25. Böhm I. et al. Monitoring of tumor burden in vivo by optical imaging in a xenograft SCID mouse model: evaluation of two fluorescent proteins of the GFP-superfamily. Acta radiol. SAGE Publications Inc., 2019; 60, 3: 315-326.

26. Terai T., Nagano T. Small-molecule fluorophores and fluorescent probes for bioimaging. Pflugers Arch.Eur. J. Physiol. Pflugers Arch, 2013; 465, 3: 347-359.

27. Chalfie M. GFP: Lighting up life. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Proc Natl Acad Sci U S A, 2009; 106, 25: 10073-10080.

28. Yuste R. Fluorescence microscopy today. Nat. Methods. Nat Methods, 2005; 2, 12: 902-904.

29. Komorowski M., Finkenstädt B., Rand D. Using a single fluorescent reporter gene to infer half-life of extrinsic noise and other parameters of gene expression. Biophys. J. Biophysical Society, 2010; 98, 12: 2759-2769.

30. File: Dividing Cell Fluorescence. jpg — Wikimedia Commons [Electronic resource]. URL: https://commons.wikimedia.org/wiki/File: Dividing_Cell_Fluorescence. jpg (accessed: 26.10.2020).

31. Shcherbo D.S. Dalnekrasnye fluorestsentnye belki [Far-red fluorescent proteins]. 2010. (In Russ.)

32. Kouros-Mehr H. et al. GATA-3 Links Tumor Differentiation and Dissemination in a Luminal Breast Cancer Model. Cancer Cell. Cancer Cell, 2008; 13, 2: 141-152.

33. Photoactivatable, photoconvertible, and photoswitchable Fluorescent Proteins | Learn & Share | Leica Microsystems [Electronic resource]. URL: https://www.leica-microsystems.com/science-lab/photoactivatable-photoconvertible-and-photoswitchable-fluorescent-proteins/(accessed: 26.10.2020).

34. Zhou X.X., Lin M.Z. Photoswitchable fluorescent proteins: Ten years of colorful chemistry and exciting applications. Curr. Opin. Chem. Biol. NIH Public Access, 2013; 17, 4: 682-690.

35. Ando R. et al. An optical marker based on the UV-induced green-to-red photoconversion of a fluorescent protein. Proc. Natl. Acad.Sci. U. S. A., 2002; 99, 20: 12651-12656.

Среди существующих методов построения изображений тканей особое место занимает оптических биоимиджинг. Под этим понятием подразумевается совокупность неинвазивных оптических методов исследования в видимой и инфракрасной областях спектра, изучающих функционирование живых и растительных организмов на клеточном и молекулярном уровнях.

Целью оптического биоимиджинга является создание новых методов диагностики. Благодаря оптическому имиджингу у ученых появляется возможность получения изображений структур биообъектов на разных уровнях: клеточном, субклеточном и тканевом. Разнообразие методик оптического биоимиджинга позволяет получать прижизненные изображения биологических объектов на разных уровнях, что является основополагающим для изучения живых систем, начиная молекулой и заканчивая целым организмом. Помимо этого, полученные изображения помогают исследователям в создании новых методов диагностики и контроля лечения в клинической практике [1].

К методам оптического имиджинга относятся флуоресцентный и биолюминесцентный, которые по разрешению делятся на методы с клеточным разрешением (микроскопические технологии), методы с разрешением на уровне слоев/групп клеток и методы с разрешением на тканевом уровне [2]:

а) методы клеточного разрешения: конфокальная микроскопия, многофотонная флуорецентная микроскопия (МФМ), оптическая флуоресцентная просветная микроскопия (ОФПМ), оптическая когерентная микроскопия (ОКМ);

b) методы разрешения на уровне слоев/групп клеток: оптическая когерентная томография (ОКТ);

с) методы разрешения на тканевом уровне: оптическая диффузионная томография (ОДТ).

Для улучшения видимости исследуемых структур в оптическом имиджинге применяются две большие группы контрастирующих агентов (маркеров): эндогенные, в норме присутствующие в клетках, и экзогенные (флуоресцирующие белки, наночастицы, органические красители и т.д.), внесенные извне [3]. Последние подразделяются на прямые неспецифические (флюоресцентные красители, наночастицы) и непрямые специфические (репортерные гены) [2].

Для Цитирования:
Пешкова Яна Алексеевна, Завадский Сергей Павлович, Флуоресцентные белки в оптическом имиджинге. ГЛАВВРАЧ. 2023;12.
Полная версия статьи доступна подписчикам журнала
Язык статьи:
Действия с выбранными: