В бассейне озера Байкал обитает жилая форма подвида плотвы сибирской Rutilus rutilus lacustris (Jakowlew, 1870), являющаяся «эндемичным подвидом Байкала» [1]. Рыба обитает в крупных притоках Байкала и в прибрежно-соровой зоне, а также в литорали озера до глубины 15–20 м, особенно вдоль восточного берега, включая Чивыркуйский залив. Вдоль западного берега плотва обитает лишь в Малом Море и в приустьевых пространствах рек, где встречается и елец [3]. Распределение рыб обусловлено расположением нерестилищ в сорах и на мелководьях заливов. В бассейне Байкала различают две экологические формы плотвы. Быстро растущая форма («байкальская сорога») большую часть жизни проводит в прибрежных районах Байкала, включая Чивыркуйский залив. Тугорослая, мелкая плотва (соровая) заселяет реки, озера и соры Байкала, например водоемы Селенгинского мелководья. В связи с обитанием в неодинаковых экологических условиях формы плотвы различаются по многим показателям [3], а потому наличие в одном месте двух форм плотвы в меняющихся пропорциях может искажать оценку состояния плотвы той или иной популяции.
Образ жизни и поведение плотвы очень похожи на таковые ельца. Это стайные рыбы, ведущие придонный образ жизни, предпочитают неглубокие участки с илистым и песчаным грунтом, с хорошо развитой водной растительностью. После нереста плотва уходит в литораль Байкала, нагуливается там, в конце лета или в начале осени вновь возвращается в залив, но зимует преимущественно в литорали Байкала. Ко времени нереста плотва возвращается в Чивыркуйский залив. Зимующие в литорали взрослые особи плотвы начинают концентрироваться в нерестовые косяки и подходить к районам нереста еще подо льдом, в феврале-марте [3]. В самом Чивыркуйском заливе миграции плотвы проходят со второй половины апреля по конец мая — начало июня. Сроки определяются степенью зрелости половых продуктов рыб в самом Байкале и, в меньшей степени, природными условиями Чивыркуйского залива [3].
Половой зрелости самцы плотвы в условиях Байкала достигают в 3–4 года, самки — годом позже при длине тела 14–18 см [4]. Нерест плотвы в Чивыркуйском заливе происходит «не ранее 25 мая … и не позднее 25 июня». В начале нереста tповерх. может различаться вдвое (4,5–10оС). Период нереста занимает 4 (10) — 15 (20) дней, поэтому tо за время нереста обычно увеличивается. Плотва использует для откладки икринок растительный субстрат, поэтому ее нерестилища находятся по всему заливу на мелководьях и до глубин в 3–4 м, а также в озере Арангатуй. У плотвы икрометание порционное [3] или единовременное [5]. В среднем в нерестовых стадах плотвы количество самцов и самок почти равное [3].