Актуальность темы. Актуальность исследования возможностей применения полногеномного анализа ассоциаций в селекционных программах с аулиекольской породой, разводимой в Республике Казахстан, диктуется возрастающими потребностями селекции в быстрых способах отбора высокопродуктивных животных, с одной стороны, и целесообразностью работы с племенным материалом, адаптированным к местным климатическим и кормовым условиям [8]. Однако такие исследования являются дорогостоящими для внедрения в практику рутинной оценки продуктивности поголовья крупного рогатого скота. Поэтому актуальность сохраняет маркирование признаков продуктивности по небольшому числу single-nucleotide polymorphism (SNP) с известными фенотипическими эффектами, которые можно объединить в небольшие диагностические ДНК-панели, доступные по стоимости [1].
Аулиекольская порода крупного рогатого скота, будучи результатом скрещивания трех мясных пород: абердин-ангусской, шаролезской и казахской белоголовой, сочетает в себе как признаки пород-предшественников, так и некоторые уникальные характеристики, поэтому порода сохраняет стабильный интерес с точки зрения генетического потенциала и селекционных возможностей.
В данной статье представлены результаты поиска и отбора породоспецифичных SNP, маркирующих повышенную мясную продуктивность на основе данных ДНК-типирования животных с помощью чипа GeneSeek GGP Bovine 150K (Illumina Inc., США) на примере аулиекольской породы [10].
Цель исследований – изучение ассоциации SNP-полиморфизмов с продуктивностью у крупного рогатого скота аулиекольской породы.
Материал и методика исследований. Для проведения молекулярно-генетических исследований использовались волосяные луковицы, отобранные от 100 гол. крупного рогатого скота аулиекольской породы. Генотипирование проведено согласно протоколу фирмы-производителя Illumina Inc. (США).
Поиск породоспецифичных участков генома проводили путем картирования рядов гомозиготности (ROH) с помощью программного пакета PLINK Cattle QTL database [2, 7, 9].