В статье дан анализ состояния высшего образования в Казахстане в контексте интеграционных процессов, в частности болонских преобразований. Изучены противоречивые моменты интеграции казахстанской системы высшего образования в единое образовательное пространство. Анализируются факторы, сдерживающие инновационное развитие высшей школы. Рассмотрены особенности Национальной системы оценки качества образования, включающей процедуры входного, промежуточного и выходного контроля. Даны рекомендации по развитию культуры качества образования, совершенствованию Национальной системы квалификаций, повышению эффективности социального партнёрства «вуз — работодатель» в разработке практико-ориентированных программ в формате компетентностного подхода.